RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465909.2

SOGA3-201, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 3,756 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-201ENST00000465909 CABP1Q9NZU7 370 aa17.19■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 CCDC158Q5M9N0 1113 aa17.19■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 OLFM4Q6UX06 510 aa17.19■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa17.19■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 ELP1O95163 1332 aa17.19■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 CHMP4BP1P59074 171 aa17.19■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa17.19■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 TCHHQ07283 1943 aa17.18■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 ZEB2O60315 1214 aa17.18■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 SAMM50Q9Y512 469 aa17.18■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 CAPN7Q9Y6W3 813 aa17.18■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 TBC1D8O95759 1140 aa17.18■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 TPCN1Q9ULQ1 816 aa17.18■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 KANK1Q14678 1352 aa17.18■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 BIRC2Q13490 618 aa17.17■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 PLB1Q6P1J6 1458 aa17.17■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 INPP5BP32019 993 aa17.17■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 PEX19P40855 299 aa17.17■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 PLEKHF1Q96S99 279 aa17.17■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 ABCC4O15439 1325 aa17.17■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 H3BQF6 201 aa17.17■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 PTH1RQ03431 593 aa17.17■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 NAA25Q14CX7 972 aa17.17■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 E9PCH4 1651 aa17.17■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 CAVIN2O95810 425 aa17.16■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa17.16■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 CTAGE5O15320 804 aa17.16■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 KIF5CO60282 957 aa17.16■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 CCT4P50991 539 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 ADKP55263 362 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 SARNPP82979 210 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 TEFQ10587 303 aa17.16■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF569Q5MCW4 686 aa17.16■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 SCLT1Q96NL6 688 aa17.16■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 FYB1O15117 783 aa17.16■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP17.16■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 TADA2BQ86TJ2 420 aa17.16■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 DHX58Q96C10 678 aa17.16■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 HYPKQ9NX55 129 aa17.16■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa17.16■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP17.15■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 AFAP1L1Q8TED9 768 aa17.15■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 BOLA2Q9H3K6 86 aa17.15■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 FANCCQ00597 558 aa17.15■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 KLHL10Q6JEL2 608 aa17.15■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 OTUD6BQ8N6M0 293 aa17.15■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 PGBD1Q96JS3 809 aa17.15■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 TOPBP1Q92547 1522 aa17.15■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 APOBRQ0VD83 1088 aa17.15■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.15■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 SGSM2O43147 1006 aa17.14■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 LONRF3Q496Y0 759 aa17.14■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.34
SOGA3-201ENST00000465909 SYNMO15061 1565 aa17.14■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 ZMYND10O75800 440 aa17.14■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 TADA3O75528 432 aa17.14■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 ATP1A3P13637 1013 aa17.14■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 MTX1Q13505 466 aa17.14■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 DPCR1Q3MIW9 517 aa17.14■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa17.13■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa17.13■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa17.13■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 CAPZA3Q96KX2 299 aa17.13■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 POLD4Q9HCU8 107 aa17.13■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP17.13■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 ARMCX5Q6P1M9 558 aa17.13■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 ABCB6Q9NP58 842 aa17.13■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 NOS1P29475 1434 aa17.13■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 CPLX1O14810 134 aa17.12■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 AACSQ86V21 672 aa17.12■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 PPFIBP1Q86W92 1011 aa17.12■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 WDR24Q96S15 920 aa17.12■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 CLASP1Q7Z460 1538 aa17.12■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 CBFA2T2O43439 604 aa17.12■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 RPSAP08865 295 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 BCAS4Q8TDM0 211 aa17.12■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 SCP2P22307 547 aa17.12■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 VPS53Q5VIR6 699 aa17.12■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 KIRREL3Q8IZU9 778 aa17.12■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 CTAGE15A4D2H0 777 aa17.11■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 CTAGE8P0CG41 777 aa17.11■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 ANKRD1Q15327 319 aa17.11■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 CTAGE6Q86UF2 777 aa17.11■□□□□ 0.33
SOGA3-201ENST00000465909 CTAGE4Q8IX94 777 aa17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms