RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 SP8Q8IXZ3 490 aa30.62■■■□□ 2.49
SMKR1-201ENST00000462322 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
SMKR1-201ENST00000462322 MIER1Q8N108 512 aa30.62■■■□□ 2.49
SMKR1-201ENST00000462322 DNAAF4Q8WXU2 420 aa30.61■■■□□ 2.49
SMKR1-201ENST00000462322 NEURL1BA8MQ27 555 aa30.6■■■□□ 2.49
SMKR1-201ENST00000462322 TOMM70O94826 608 aa30.6■■■□□ 2.49
SMKR1-201ENST00000462322 SLFN5Q08AF3 891 aa30.6■■■□□ 2.49
SMKR1-201ENST00000462322 PDE8AO60658 829 aa30.59■■■□□ 2.49
SMKR1-201ENST00000462322 TMC4Q7Z404 712 aa30.59■■■□□ 2.49
SMKR1-201ENST00000462322 TAF1P21675 1872 aa30.59■■■□□ 2.49
SMKR1-201ENST00000462322 CDHR2Q9BYE9 1310 aa30.58■■■□□ 2.49
SMKR1-201ENST00000462322 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
SMKR1-201ENST00000462322 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
SMKR1-201ENST00000462322 JDP2Q8WYK2 163 aa30.57■■■□□ 2.48
SMKR1-201ENST00000462322 DDNO94850 711 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC152Q4G0S7 254 aa30.56■■■□□ 2.48
SMKR1-201ENST00000462322 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
SMKR1-201ENST00000462322 LARGE2Q8N3Y3 721 aa30.56■■■□□ 2.48
SMKR1-201ENST00000462322 MPNDQ8N594 471 aa30.56■■■□□ 2.48
SMKR1-201ENST00000462322 CDCA7LQ96GN5 454 aa30.56■■■□□ 2.48
SMKR1-201ENST00000462322 SUPT20HQ8NEM7 779 aa30.55■■■□□ 2.48
SMKR1-201ENST00000462322 LINS1Q8NG48 757 aa30.55■■■□□ 2.48
SMKR1-201ENST00000462322 F6X3S4 739 aa30.54■■■□□ 2.48
SMKR1-201ENST00000462322 GCKRQ14397 625 aa30.54■■■□□ 2.48
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
SMKR1-201ENST00000462322 RPS8P62241 208 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
SMKR1-201ENST00000462322 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa30.53■■■□□ 2.48
SMKR1-201ENST00000462322 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
SMKR1-201ENST00000462322 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
SMKR1-201ENST00000462322 SEC31BQ9NQW1 1179 aa30.53■■■□□ 2.48
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF541Q9H0D2 1346 aa30.52■■■□□ 2.48
SMKR1-201ENST00000462322 H7C1W4 665 aa30.52■■■□□ 2.48
SMKR1-201ENST00000462322 FZD9O00144 591 aa30.52■■■□□ 2.48
SMKR1-201ENST00000462322 PPIP5K2O43314 1243 aa30.52■■■□□ 2.48
SMKR1-201ENST00000462322 WDR90Q96KV7 1748 aa30.52■■■□□ 2.48
SMKR1-201ENST00000462322 POTECB2RU33 542 aa30.51■■■□□ 2.47
SMKR1-201ENST00000462322 CTSWP56202 376 aa30.5■■■□□ 2.47
SMKR1-201ENST00000462322 AOC3Q16853 763 aa30.5■■■□□ 2.47
SMKR1-201ENST00000462322 VPS33BQ9H267 617 aa30.5■■■□□ 2.47
SMKR1-201ENST00000462322 EIF6P56537 245 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
SMKR1-201ENST00000462322 NIM1KQ8IY84 436 aa30.49■■■□□ 2.47
SMKR1-201ENST00000462322 COL4A1P02462 1669 aa30.49■■■□□ 2.47
SMKR1-201ENST00000462322 COL4A5P29400 1685 aa30.49■■■□□ 2.47
SMKR1-201ENST00000462322 BEND3Q5T5X7 828 aa30.48■■■□□ 2.47
SMKR1-201ENST00000462322 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
SMKR1-201ENST00000462322 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
SMKR1-201ENST00000462322 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
SMKR1-201ENST00000462322 TTLL11Q8NHH1 800 aa30.47■■■□□ 2.47
SMKR1-201ENST00000462322 LRRC37AA6NMS7 1700 aa30.47■■■□□ 2.47
SMKR1-201ENST00000462322 HSPA6P17066 643 aa30.46■■■□□ 2.47
SMKR1-201ENST00000462322 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
SMKR1-201ENST00000462322 GPSM2P81274 684 aa30.45■■■□□ 2.47
SMKR1-201ENST00000462322 SLC4A10Q6U841 1118 aa30.45■■■□□ 2.47
SMKR1-201ENST00000462322 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa30.45■■■□□ 2.47
SMKR1-201ENST00000462322 GPC2Q8N158 579 aa30.45■■■□□ 2.47
SMKR1-201ENST00000462322 SSH1Q8WYL5 1049 aa30.45■■■□□ 2.47
SMKR1-201ENST00000462322 IQCA1LA6NCM1 817 aa30.44■■■□□ 2.46
SMKR1-201ENST00000462322 CASP7P55210 303 aa30.44■■■□□ 2.46
SMKR1-201ENST00000462322 KIAA2012Q0VF49 1180 aa30.44■■■□□ 2.46
SMKR1-201ENST00000462322 FSTL1Q12841 308 aa30.44■■■□□ 2.46
SMKR1-201ENST00000462322 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
SMKR1-201ENST00000462322 PLA2G12BQ9BX93 195 aa30.44■■■□□ 2.46
SMKR1-201ENST00000462322 GREM2Q9H772 168 aa30.44■■■□□ 2.46
SMKR1-201ENST00000462322 GJA3Q9Y6H8 435 aa30.44■■■□□ 2.46
SMKR1-201ENST00000462322 SMC1BQ8NDV3 1235 aa30.43■■■□□ 2.46
SMKR1-201ENST00000462322 MYH3P11055 1940 aa30.43■■■□□ 2.46
SMKR1-201ENST00000462322 C6orf229H3BNL8 230 aa30.42■■■□□ 2.46
SMKR1-201ENST00000462322 BCL2L13Q9BXK5 485 aa30.42■■■□□ 2.46
SMKR1-201ENST00000462322 ZNRF3Q9ULT6 936 aa30.42■■■□□ 2.46
SMKR1-201ENST00000462322 DUOX1Q9NRD9 1551 aa30.41■■■□□ 2.46
SMKR1-201ENST00000462322 RTL9Q8NET4 1388 aa30.41■■■□□ 2.46
SMKR1-201ENST00000462322 WASHC4Q2M389 1173 aa30.4■■■□□ 2.46
SMKR1-201ENST00000462322 ALDH1L2Q3SY69 923 aa30.4■■■□□ 2.46
SMKR1-201ENST00000462322 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa30.4■■■□□ 2.46
SMKR1-201ENST00000462322 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa30.4■■■□□ 2.46
SMKR1-201ENST00000462322 POLLQ9UGP5 575 aa30.4■■■□□ 2.46
SMKR1-201ENST00000462322 ALDH1L1O75891 902 aa30.39■■■□□ 2.46
SMKR1-201ENST00000462322 HACL1Q9UJ83 578 aa30.39■■■□□ 2.46
SMKR1-201ENST00000462322 PTPRCP08575 1304 aa30.39■■■□□ 2.46
SMKR1-201ENST00000462322 SCN4AP35499 1836 aa30.38■■■□□ 2.45
SMKR1-201ENST00000462322 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
SMKR1-201ENST00000462322 TBC1D16Q8TBP0 767 aa30.38■■■□□ 2.45
SMKR1-201ENST00000462322 EYA3Q99504 573 aa30.38■■■□□ 2.45
SMKR1-201ENST00000462322 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
SMKR1-201ENST00000462322 SMC4Q9NTJ3 1288 aa30.38■■■□□ 2.45
SMKR1-201ENST00000462322 PODXL2Q9NZ53 605 aa30.38■■■□□ 2.45
SMKR1-201ENST00000462322 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
SMKR1-201ENST00000462322 GRM8O00222 908 aa30.37■■■□□ 2.45
SMKR1-201ENST00000462322 RIMBP2O15034 1052 aa30.37■■■□□ 2.45
SMKR1-201ENST00000462322 CSF1RP07333 972 aa30.36■■■□□ 2.45
SMKR1-201ENST00000462322 FAM161AQ3B820 660 aa30.36■■■□□ 2.45
SMKR1-201ENST00000462322 UFL1O94874 794 aa30.35■■■□□ 2.45
SMKR1-201ENST00000462322 ITGA6P23229 1130 aa30.35■■■□□ 2.45
SMKR1-201ENST00000462322 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP30.35■■■□□ 2.45
SMKR1-201ENST00000462322 CXCL9Q07325 125 aa30.35■■■□□ 2.45
SMKR1-201ENST00000462322 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
SMKR1-201ENST00000462322 GGA1Q9UJY5 639 aa30.35■■■□□ 2.45
SMKR1-201ENST00000462322 LTBP1Q14766 1721 aa30.34■■■□□ 2.45
SMKR1-201ENST00000462322 EPHX2P34913 555 aa30.34■■■□□ 2.45
SMKR1-201ENST00000462322 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.3 ms