RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	RTL9	Q8NET4	1388 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PTPA-222	ENST00000445241	ABCC4	O15439	1325 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PTPA-222	ENST00000445241	YY1	P25490	414 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PTPA-222	ENST00000445241	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PTPA-222	ENST00000445241	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PTPA-222	ENST00000445241	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	GRM8	O00222	908 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	CTSW	P56202	376 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	UTY	O14607	1347 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	SNED1	Q8TER0	1413 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	TAF1	P21675	1872 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	NFKBIE	O00221	500 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	LMNB1	P20700	586 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	SP8	Q8IXZ3	490 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	PSMD1	Q99460	953 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	18.48	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	CSF1R	P07333	972 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	VPS33B	Q9H267	617 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	BCAR3	O75815	825 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PTPA-222	ENST00000445241	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		18.45	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		18.45	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	RASSF7	Q02833	373 aa		18.44	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		18.44	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		18.44	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		18.44	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	RNF181	Q9P0P0	153 aa		18.44	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	LTBP1	Q14766	1721 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	TRIM27	P14373	513 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	FOXO4	P98177	505 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	USP44	Q9H0E7	712 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	GREM2	Q9H772	168 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	ITGA6	P23229	1130 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	OLFM4	Q6UX06	510 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	MPND	Q8N594	471 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	SPEF2	Q9C093	1822 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	COL4A1	P02462	1669 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	MS4A1	P11836	297 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	PRELP	P51888	382 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PTPA-222	ENST00000445241	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	FAM161A	Q3B820	660 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	SUCLG2	Q96I99	432 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	GNAI3	P08754	354 aa		18.38	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	KAZALD1	Q96I82	304 aa		18.38	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		18.37	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		18.37	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		18.37	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	XDH	P47989	1333 aa		18.37	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		18.36	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		18.36	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	JDP2	Q8WYK2	163 aa		18.36	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	EYA3	Q99504	573 aa		18.36	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1B0GUL6	1792 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	GLTPD2	A6NH11	291 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	FZD9	O00144	591 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	GPSM2	P81274	684 aa		18.34	■□□□□ 0.53

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