RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428445.1

VARS-216, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 5

Gene VARS, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-216ENST00000428445 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.65■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 ZNRF3Q9ULT6 936 aa21.65■■□□□ 1.06
VARS-216ENST00000428445 SHTN1A0MZ66 631 aa21.64■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.64■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.64■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.63■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.63■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.63■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 YDJCA8MPS7 323 aa21.62■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 GRAPQ13588 217 aa21.62■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.62■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 RUNDC1Q96C34 613 aa21.62■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 FAM89AQ96GI7 184 aa21.62■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 COL4A1P02462 1669 aa21.61■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.61■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.61■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 CIAPIN1Q6FI81 312 aa21.61■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 CAPNS2Q96L46 248 aa21.61■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 VPS33BQ9H267 617 aa21.61■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 DLK2Q6UY11 383 aa21.6■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.6■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.6■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 AOC2O75106 756 aa21.59■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.59■■□□□ 1.059e-6■■■□□ 15.6
VARS-216ENST00000428445 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.59■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 TRPM4Q8TD43 1214 aa21.59■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.59■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 RIMBP2O15034 1052 aa21.58■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 TSKSQ9UJT2 592 aa21.58■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.58■■□□□ 1.05
VARS-216ENST00000428445 DUOX1Q9NRD9 1551 aa21.57■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.57■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.57■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 KCNQ5Q9NR82 932 aa21.57■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 DBNDD1Q9H9R9 158 aa21.56■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 MBIPQ9NS73 344 aa21.56■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 GPSM2P81274 684 aa21.55■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 TNIP1Q15025 636 aa21.55■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 POLLQ9UGP5 575 aa21.55■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 ECE1P42892 770 aa21.54■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 DOK7Q18PE1 504 aa21.54■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 SAMD7Q7Z3H4 446 aa21.54■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.54■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 C6orf229H3BNL8 230 aa21.53■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 PSMD14O00487 310 aa21.53■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 WASHC4Q2M389 1173 aa21.53■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 SAPCD2Q86UD0 394 aa21.53■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 USP48Q86UV5 1035 aa21.53■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 MICALL2Q8IY33 904 aa21.53■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 CFAP44Q96MT7 982 aa21.53■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 EGFRP00533 1210 aa21.52■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 HYPKQ9NX55 129 aa21.52■■□□□ 1.04
VARS-216ENST00000428445 LRRC37AA6NMS7 1700 aa21.52■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.51■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 H7C1D1 291 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 APAF1O14727 1248 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 HOXB7P09629 217 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 ABHD8Q96I13 439 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.5■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 ZNF853P0CG23 659 aa21.49■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 CDC37L1Q7L3B6 337 aa21.49■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 TMC4Q7Z404 712 aa21.49■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 ZIC5Q96T25 663 aa21.49■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 MYD88Q99836 296 aa21.49■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 BEGAINQ9BUH8 593 aa21.49■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 ECE2O60344 883 aa21.48■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.48■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 RTL9Q8NET4 1388 aa21.48■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.47■■□□□ 1.03
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