RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC152Q4G0S7 254 aa26.84■■□□□ 1.89
SH3BP4-204ENST00000416021 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26.84■■□□□ 1.89
SH3BP4-204ENST00000416021 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.84■■□□□ 1.89
SH3BP4-204ENST00000416021 GLTPD2A6NH11 291 aa26.83■■□□□ 1.89
SH3BP4-204ENST00000416021 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
SH3BP4-204ENST00000416021 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
SH3BP4-204ENST00000416021 RPS8P62241 208 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
SH3BP4-204ENST00000416021 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.83■■□□□ 1.89
SH3BP4-204ENST00000416021 DPY19L2Q6NUT2 758 aa26.83■■□□□ 1.89
SH3BP4-204ENST00000416021 TMC4Q7Z404 712 aa26.83■■□□□ 1.89
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
SH3BP4-204ENST00000416021 SEC31BQ9NQW1 1179 aa26.83■■□□□ 1.89
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.82■■□□□ 1.88
SH3BP4-204ENST00000416021 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.82■■□□□ 1.88
SH3BP4-204ENST00000416021 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.82■■□□□ 1.88
SH3BP4-204ENST00000416021 SBF1O95248 1867 aa26.81■■□□□ 1.88
SH3BP4-204ENST00000416021 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.81■■□□□ 1.88
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF3CO14782 793 aa26.81■■□□□ 1.88
SH3BP4-204ENST00000416021 MPNDQ8N594 471 aa26.81■■□□□ 1.88
SH3BP4-204ENST00000416021 RRAGCQ9HB90 399 aa26.81■■□□□ 1.88
SH3BP4-204ENST00000416021 SNED1Q8TER0 1413 aa26.81■■□□□ 1.88
SH3BP4-204ENST00000416021 CASP7P55210 303 aa26.8■■□□□ 1.88
SH3BP4-204ENST00000416021 CTSWP56202 376 aa26.8■■□□□ 1.88
SH3BP4-204ENST00000416021 TTLL11Q8NHH1 800 aa26.8■■□□□ 1.88
SH3BP4-204ENST00000416021 CACNA1SQ13698 1873 aa26.79■■□□□ 1.88
SH3BP4-204ENST00000416021 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
SH3BP4-204ENST00000416021 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.79■■□□□ 1.88
SH3BP4-204ENST00000416021 C1QTNF8P60827 252 aa26.78■■□□□ 1.88
SH3BP4-204ENST00000416021 PLA2G12BQ9BX93 195 aa26.78■■□□□ 1.88
SH3BP4-204ENST00000416021 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
SH3BP4-204ENST00000416021 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.78■■□□□ 1.88
SH3BP4-204ENST00000416021 PTPRCP08575 1304 aa26.78■■□□□ 1.88
SH3BP4-204ENST00000416021 ALDH1L1O75891 902 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP4-204ENST00000416021 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP4-204ENST00000416021 JDP2Q8WYK2 163 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP4-204ENST00000416021 CACNA1FO60840 1977 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.88
SH3BP4-204ENST00000416021 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP4-204ENST00000416021 VPS33BQ9H267 617 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP4-204ENST00000416021 GREM2Q9H772 168 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP4-204ENST00000416021 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
SH3BP4-204ENST00000416021 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
SH3BP4-204ENST00000416021 FZD9O00144 591 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP4-204ENST00000416021 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
SH3BP4-204ENST00000416021 CSF1RP07333 972 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP4-204ENST00000416021 LAMB2P55268 1798 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP4-204ENST00000416021 GRM8O00222 908 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP4-204ENST00000416021 PPIP5K2O43314 1243 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP4-204ENST00000416021 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SH3BP4-204ENST00000416021 GPSM2P81274 684 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP4-204ENST00000416021 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SH3BP4-204ENST00000416021 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SH3BP4-204ENST00000416021 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
SH3BP4-204ENST00000416021 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
SH3BP4-204ENST00000416021 AOC3Q16853 763 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP4-204ENST00000416021 POTECB2RU33 542 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 TOMM70O94826 608 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 FOXO4P98177 505 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 NIM1KQ8IY84 436 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 POLLQ9UGP5 575 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 RTL9Q8NET4 1388 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 C6orf229H3BNL8 230 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 ITGA6P23229 1130 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.67■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 WASHC4Q2M389 1173 aa26.67■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.67■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.67■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 TAF1P21675 1872 aa26.67■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 COL4A1P02462 1669 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM161AQ3B820 660 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 TBC1D16Q8TBP0 767 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 MINPP1Q9UNW1 487 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 UTYO14607 1347 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 RIMBP2O15034 1052 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 GPC2Q8N158 579 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 SUCLG2Q96I99 432 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 EYA3Q99504 573 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 GGA1Q9UJY5 639 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP4-204ENST00000416021 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
SH3BP4-204ENST00000416021 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
SH3BP4-204ENST00000416021 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
SH3BP4-204ENST00000416021 MPHOSPH8Q99549 860 aa26.63■■□□□ 1.85
SH3BP4-204ENST00000416021 USP44Q9H0E7 712 aa26.63■■□□□ 1.85
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