RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-202ENST00000400053 DCTPP1Q9H773 170 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-202ENST00000400053 PRDM11Q9NQV5 511 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-202ENST00000400053 DMRT2Q9Y5R5 561 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-202ENST00000400053 PTPRTO14522 1441 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-202ENST00000400053 USO1O60763 962 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-202ENST00000400053 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRM-202ENST00000400053 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
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PTPRM-202ENST00000400053 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
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PTPRM-202ENST00000400053 CCDC150Q8NCX0 1101 aa10.2□□□□□ -0.78
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PTPRM-202ENST00000400053 SPECC1Q5M775 1068 aa10.2□□□□□ -0.78
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PTPRM-202ENST00000400053 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa10.19□□□□□ -0.78
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PTPRM-202ENST00000400053 ABCA8O94911 1581 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRM-202ENST00000400053 HS1BP3Q53T59 392 aa10.19□□□□□ -0.78
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PTPRM-202ENST00000400053 CAVIN2O95810 425 aa10.19□□□□□ -0.78
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PTPRM-202ENST00000400053 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRM-202ENST00000400053 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa10.19□□□□□ -0.78
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PTPRM-202ENST00000400053 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa10.18□□□□□ -0.78
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PTPRM-202ENST00000400053 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
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PTPRM-202ENST00000400053 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
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PTPRM-202ENST00000400053 PLCD3Q8N3E9 789 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRM-202ENST00000400053 GOPCQ9HD26 462 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRM-202ENST00000400053 JADE2Q9NQC1 790 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRM-202ENST00000400053 HOMER2Q9NSB8 354 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRM-202ENST00000400053 PHACTR2O75167 634 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRM-202ENST00000400053 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa10.16□□□□□ -0.78
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