RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317096.8

PARL-202, Transcript of presenilin associated rhomboid like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PARL, Length 1,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARL-202ENST00000317096 CLUAP1Q96AJ1 413 aa30.41■■■□□ 2.46
PARL-202ENST00000317096 BCS1LQ9Y276 419 aa30.41■■■□□ 2.46
PARL-202ENST00000317096 C7orf43Q8WVR3 580 aa30.4■■■□□ 2.46
PARL-202ENST00000317096 SNED1Q8TER0 1413 aa30.4■■■□□ 2.46
PARL-202ENST00000317096 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa30.4■■■□□ 2.46
PARL-202ENST00000317096 FOXO4P98177 505 aa30.39■■■□□ 2.46
PARL-202ENST00000317096 EPHA10Q5JZY3 1008 aa30.39■■■□□ 2.46
PARL-202ENST00000317096 TTLL6Q8N841 843 aa30.39■■■□□ 2.46
PARL-202ENST00000317096 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP30.39■■■□□ 2.46
PARL-202ENST00000317096 CRAMP1Q96RY5 1269 aa30.39■■■□□ 2.46
PARL-202ENST00000317096 SLC51AQ86UW1 340 aa30.39■■■□□ 2.45
PARL-202ENST00000317096 TTLL11Q8NHH1 800 aa30.39■■■□□ 2.45
PARL-202ENST00000317096 PLIN1O60240 522 aa30.38■■■□□ 2.45
PARL-202ENST00000317096 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
PARL-202ENST00000317096 TMEM57Q8N5G2 664 aa30.38■■■□□ 2.45
PARL-202ENST00000317096 CSF1RP07333 972 aa30.37■■■□□ 2.45
PARL-202ENST00000317096 CTSWP56202 376 aa30.37■■■□□ 2.45
PARL-202ENST00000317096 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
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PARL-202ENST00000317096 SUCLG2Q96I99 432 aa30.36■■■□□ 2.45
PARL-202ENST00000317096 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
PARL-202ENST00000317096 RTL9Q8NET4 1388 aa30.36■■■□□ 2.45
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PARL-202ENST00000317096 A0A1B0GUL6 1792 aa30.34■■■□□ 2.45
PARL-202ENST00000317096 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
PARL-202ENST00000317096 PANK1Q8TE04 598 aa30.33■■■□□ 2.45
PARL-202ENST00000317096 MEIS3Q99687 375 aa30.33■■■□□ 2.45
PARL-202ENST00000317096 SEC31BQ9NQW1 1179 aa30.33■■■□□ 2.45
PARL-202ENST00000317096 ALDH1B1P30837 517 aa30.32■■■□□ 2.44
PARL-202ENST00000317096 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
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PARL-202ENST00000317096 ANKRD44Q8N8A2 993 aa30.31■■■□□ 2.44
PARL-202ENST00000317096 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
PARL-202ENST00000317096 GREM2Q9H772 168 aa30.31■■■□□ 2.44
PARL-202ENST00000317096 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
PARL-202ENST00000317096 C20orf194Q5TEA3 1177 aa30.3■■■□□ 2.44
PARL-202ENST00000317096 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
PARL-202ENST00000317096 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
PARL-202ENST00000317096 GRAPQ13588 217 aa30.29■■■□□ 2.44
PARL-202ENST00000317096 CCDC152Q4G0S7 254 aa30.29■■■□□ 2.44
PARL-202ENST00000317096 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
PARL-202ENST00000317096 C21orf2O43822 256 aa30.28■■■□□ 2.44
PARL-202ENST00000317096 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa30.28■■■□□ 2.44
PARL-202ENST00000317096 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
PARL-202ENST00000317096 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
PARL-202ENST00000317096 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
PARL-202ENST00000317096 FAM161AQ3B820 660 aa30.27■■■□□ 2.44
PARL-202ENST00000317096 LMBR1LQ6UX01 489 aa30.26■■■□□ 2.43
PARL-202ENST00000317096 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
PARL-202ENST00000317096 DUOX1Q9NRD9 1551 aa30.25■■■□□ 2.43
PARL-202ENST00000317096 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
PARL-202ENST00000317096 PDE3AQ14432 1141 aa30.25■■■□□ 2.43
PARL-202ENST00000317096 BBOX1O75936 387 aa30.24■■■□□ 2.43
PARL-202ENST00000317096 PRELPP51888 382 aa30.24■■■□□ 2.43
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PARL-202ENST00000317096 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
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PARL-202ENST00000317096 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
PARL-202ENST00000317096 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa30.23■■■□□ 2.43
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PARL-202ENST00000317096 GNAI3P08754 354 aa30.2■■■□□ 2.42
PARL-202ENST00000317096 MS4A1P11836 297 aa30.2■■■□□ 2.42
PARL-202ENST00000317096 MVPQ14764 893 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.42
PARL-202ENST00000317096 ITPRIPQ8IWB1 547 aa30.2■■■□□ 2.42
PARL-202ENST00000317096 COG6Q9Y2V7 657 aa30.19■■■□□ 2.42
PARL-202ENST00000317096 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
PARL-202ENST00000317096 LTBP3Q9NS15 1303 aa30.18■■■□□ 2.42
PARL-202ENST00000317096 CCDC93Q567U6 631 aa30.17■■■□□ 2.42
PARL-202ENST00000317096 TMC4Q7Z404 712 aa30.17■■■□□ 2.42
PARL-202ENST00000317096 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
PARL-202ENST00000317096 RASSF7Q02833 373 aa30.16■■■□□ 2.42
PARL-202ENST00000317096 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa30.16■■■□□ 2.42
PARL-202ENST00000317096 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
PARL-202ENST00000317096 MTX1Q13505 466 aa30.15■■■□□ 2.42
PARL-202ENST00000317096 SOGA3Q5TF21 947 aa30.15■■■□□ 2.42
PARL-202ENST00000317096 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa30.15■■■□□ 2.42
PARL-202ENST00000317096 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
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PARL-202ENST00000317096 TIAM2Q8IVF5 1701 aa30.15■■■□□ 2.42
PARL-202ENST00000317096 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
PARL-202ENST00000317096 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa30.13■■■□□ 2.41
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PARL-202ENST00000317096 PSMD1Q99460 953 aa30.13■■■□□ 2.41
PARL-202ENST00000317096 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa30.13■■■□□ 2.41
PARL-202ENST00000317096 RTKN2Q8IZC4 609 aa30.12■■■□□ 2.41
PARL-202ENST00000317096 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
PARL-202ENST00000317096 MINPP1Q9UNW1 487 aa30.12■■■□□ 2.41
PARL-202ENST00000317096 CHMP3Q9Y3E7 222 aa30.12■■■□□ 2.41
PARL-202ENST00000317096 DDX19BQ9UMR2 479 aa30.11■■■□□ 2.41
PARL-202ENST00000317096 GPSM2P81274 684 aa30.1■■■□□ 2.41
PARL-202ENST00000317096 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP30.1■■■□□ 2.41
PARL-202ENST00000317096 CCDC57Q2TAC2 916 aa30.1■■■□□ 2.41
PARL-202ENST00000317096 TAOK3Q9H2K8 898 aa30.1■■■□□ 2.41
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