RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303731.8

TRAPPC1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC1, Length 811 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-201ENST00000303731 LRRC37AA6NMS7 1700 aa21.49■■□□□ 1.03
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TRAPPC1-201ENST00000303731 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 MRS2Q9HD23 443 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 CREBZFQ9NS37 354 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 IL16Q14005 1332 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 WWC1Q8IX03 1113 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.48■■□□□ 1.03
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TRAPPC1-201ENST00000303731 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 PASKQ96RG2 1323 aa21.47■■□□□ 1.03
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TRAPPC1-201ENST00000303731 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.46■■□□□ 1.03
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TRAPPC1-201ENST00000303731 MYD88Q99836 296 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC1-201ENST00000303731 SLC51AQ86UW1 340 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC1-201ENST00000303731 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC1-201ENST00000303731 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC1-201ENST00000303731 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.44■■□□□ 1.02
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TRAPPC1-201ENST00000303731 KSR2Q6VAB6 950 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC1-201ENST00000303731 DUOX1Q9NRD9 1551 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC1-201ENST00000303731 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.41■■□□□ 1.02
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TRAPPC1-201ENST00000303731 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC1-201ENST00000303731 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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TRAPPC1-201ENST00000303731 PDE8AO60658 829 aa21.4■■□□□ 1.02
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TRAPPC1-201ENST00000303731 EPS15P42566 896 aa21.39■■□□□ 1.01
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TRAPPC1-201ENST00000303731 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC1-201ENST00000303731 C6orf229H3BNL8 230 aa21.35■■□□□ 1.01
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TRAPPC1-201ENST00000303731 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.35■■□□□ 1.01
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TRAPPC1-201ENST00000303731 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
TRAPPC1-201ENST00000303731 DBNDD1Q9H9R9 158 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC1-201ENST00000303731 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.3■■□□□ 1
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