RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291901.12

TNNT1-201, Transcript of troponin T1, slow skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNNT1, Length 967 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1-201ENST00000291901 GRAPQ13588 217 aa21.8■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 CFAP44Q96MT7 982 aa21.8■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 MBIPQ9NS73 344 aa21.8■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 ZNRF3Q9ULT6 936 aa21.8■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.79■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.79■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 HOXB7P09629 217 aa21.78■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 VPS33BQ9H267 617 aa21.78■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 COL4A1P02462 1669 aa21.77■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 TRAF5O00463 557 aa21.77■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 APAF1O14727 1248 aa21.77■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 RAD17O75943 681 aa21.77■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.77■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 HYPKQ9NX55 129 aa21.77■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 GPRC5DQ9NZD1 345 aa21.77■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 LRRC37AA6NMS7 1700 aa21.77■■□□□ 1.08
TNNT1-201ENST00000291901 RASSF10A6NK89 507 aa21.76■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.76■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 DUOX1Q9NRD9 1551 aa21.76■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 CIAPIN1Q6FI81 312 aa21.75■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 AIDAQ96BJ3 306 aa21.75■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.74■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 ZNF853P0CG23 659 aa21.73■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 GRM1Q13255 1194 aa21.73■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.73■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 YDJCA8MPS7 323 aa21.72■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 RIMBP2O15034 1052 aa21.72■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 CST9Q5W186 159 aa21.72■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 WBP1LQ9NX94 342 aa21.72■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 SHTN1A0MZ66 631 aa21.71■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 GNAI1P63096 354 aa21.71■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 TNIP1Q15025 636 aa21.71■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 TMC4Q7Z404 712 aa21.71■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 IFT57Q9NWB7 429 aa21.71■■□□□ 1.07
TNNT1-201ENST00000291901 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 GPSM2P81274 684 aa21.7■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 GOLGA2Q08379 1002 aa21.7■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 WASHC4Q2M389 1173 aa21.7■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.7■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 MYD88Q99836 296 aa21.7■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 DBNDD1Q9H9R9 158 aa21.7■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 C6orf229H3BNL8 230 aa21.69■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 LBX1P52954 281 aa21.69■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.69■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 TRPM4Q8TD43 1214 aa21.68■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 CAPNS2Q96L46 248 aa21.68■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 POLLQ9UGP5 575 aa21.68■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 DOK7Q18PE1 504 aa21.67■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.67■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.67■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.67■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.66■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 PSMD14O00487 310 aa21.66■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 MICALL2Q8IY33 904 aa21.66■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 KCNQ5Q9NR82 932 aa21.66■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.66■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 CCDC184Q52MB2 194 aa21.65■■□□□ 1.06
TNNT1-201ENST00000291901 H7C1D1 291 aa21.64■■□□□ 1.05
TNNT1-201ENST00000291901 SAMD7Q7Z3H4 446 aa21.64■■□□□ 1.05
TNNT1-201ENST00000291901 TSPYL6Q8N831 410 aa21.64■■□□□ 1.05
TNNT1-201ENST00000291901 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.64■■□□□ 1.05
TNNT1-201ENST00000291901 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.64■■□□□ 1.05
TNNT1-201ENST00000291901 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.64■■□□□ 1.05
TNNT1-201ENST00000291901 ECE2O60344 883 aa21.63■■□□□ 1.05
TNNT1-201ENST00000291901 AOC2O75106 756 aa21.63■■□□□ 1.05
TNNT1-201ENST00000291901 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
TNNT1-201ENST00000291901 ECE1P42892 770 aa21.63■■□□□ 1.05
TNNT1-201ENST00000291901 DLK2Q6UY11 383 aa21.63■■□□□ 1.05
TNNT1-201ENST00000291901 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
TNNT1-201ENST00000291901 SCN9AQ15858 1988 aa21.63■■□□□ 1.05
TNNT1-201ENST00000291901 SPEF2Q9C093 1822 aa21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms