RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291574.8

TRAPPC10-201, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 6,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRIM47Q96LD4 638 aa15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 ALG1Q9BT22 464 aa15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 CAPN2P17655 700 aa15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 RAB34Q9BZG1 259 aa15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 FOXO3O43524 673 aa15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 NPHP3Q7Z494 1330 aa15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 ATP8B2P98198 1209 aa15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 KANK3Q6NY19 840 aa15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 CPA1P15085 419 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 CETN2P41208 172 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 USP26Q9BXU7 913 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 CHPF2Q9P2E5 772 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM266Q2M3C6 531 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 WWC2Q6AWC2 1192 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 RRAGBQ5VZM2 374 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 CEP85Q6P2H3 762 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 VAMP4O75379 141 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 KARSQ15046 597 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 CHST3Q7LGC8 479 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 MFSD6Q6ZSS7 791 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 IFNKQ9P0W0 207 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 VAT1LQ9HCJ6 419 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC5A1P13866 664 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF287Q9HBT7 754 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP15.6■□□□□ 0.092e-6■■■□□ 19.2
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP15.6■□□□□ 0.095e-6■□□□□ 8.4
TRAPPC10-201ENST00000291574 GTF3C6Q969F1 213 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 MYZAPP0CAP1 466 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 LZTFL1Q9NQ48 299 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMOD3Q9NYL9 352 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 DTNBO60941 627 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 ANKLE2Q86XL3 938 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 CCDC96Q2M329 555 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 SPTLC2O15270 562 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZBTB43O43298 467 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 HSF2BPO75031 334 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 ATRIPQ8WXE1 791 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 RTL1A6NKG5 1358 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 CALML4Q96GE6 196 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 RALGAPBQ86X10 1494 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 CHMLP26374 656 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 CCDC91Q7Z6B0 441 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 STX17P56962 302 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 EHBP1Q8NDI1 1231 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 VPS18Q9P253 973 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 POTEJP0CG39 1038 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 TSPY2A6NKD2 308 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM173BQ6P4H8 233 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 CEP112Q8N8E3 955 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 GOLGA1Q92805 767 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 IVLP07476 585 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 RHOXF2BP0C7M4 288 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 AMPD3Q01432 767 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 RHOXF2Q9BQY4 288 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 KIF20AO95235 890 aa15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 TESK2Q96S53 571 aa15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP15.56■□□□□ 0.083e-7■■□□□ 12.2
TRAPPC10-201ENST00000291574 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 C10orf67Q8IYJ2 551 aa15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 MICALL1Q8N3F8 863 aa15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 CTAGE9A4FU28 777 aa15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 APOBRQ0VD83 1088 aa15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 CREB3L3Q68CJ9 461 aa15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 OGFRQ9NZT2 677 aa15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 WTAPQ15007 396 aa15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.1 ms