RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256474.2

VHL-201, Transcript of von Hippel-Lindau tumor suppressor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VHL, Length 3,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHL-201ENST00000256474 TYRO3Q06418 890 aa15.99■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 GORABQ5T7V8 394 aa15.99■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 CCDC186Q7Z3E2 898 aa15.99■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 FMNL2Q96PY5 1086 aa15.99■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.99■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 NRBP1Q9UHY1 535 aa15.99■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 HDAC5Q9UQL6 1122 aa15.99■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 KRT28Q7Z3Y7 464 aa15.99■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 CBX1P83916 185 aa15.99■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 ZNF790Q6PG37 636 aa15.99■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 LMBR1LQ6UX01 489 aa15.99■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 SPDYE4A6NLX3 237 aa15.98■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 STK11IPQ8N1F8 1099 aa15.98■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 NR1I2O75469 434 aa15.98■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 NEK1Q96PY6 1258 aa15.98■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa15.98■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 MAP4K1Q92918 833 aa15.98■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 PDCP20941 246 aa15.97■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 RPS6KB1P23443 525 aa15.97■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 MCM5P33992 734 aa15.97■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 APOBRQ0VD83 1088 aa15.97■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 A0A0G2JLW4 131 aa15.97■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa15.97■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 NEURL1BA8MQ27 555 aa15.97■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa15.97■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 NPHP1O15259 732 aa15.97■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 GCKRQ14397 625 aa15.97■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 WASHC4Q2M389 1173 aa15.97■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 HIP1O00291 1037 aa15.96■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 TATP17735 454 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 BECN2A8MW95 431 aa15.96■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa15.96■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 IGSF3O75054 1194 aa15.96■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 PIBF1Q8WXW3 757 aa15.96■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 ZNF165P49910 485 aa15.96■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 ISM2Q6H9L7 571 aa15.96■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 BABAM1Q9NWV8 329 aa15.96■□□□□ 0.15
VHL-201ENST00000256474 ME1P48163 572 aa15.95■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 CABP4P57796 275 aa15.95■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 UVSSAQ2YD98 709 aa15.95■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 DIP2AQ14689 1571 aa15.95■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 CBX8Q9HC52 389 aa15.95■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 ARHGEF25Q86VW2 580 aa15.94■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 DYNC1I1O14576 645 aa15.94■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 ANKRD1Q15327 319 aa15.94■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 TNNI3KQ59H18 835 aa15.94■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 FAM200AQ8TCP9 573 aa15.94■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa15.94■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 AKAP12Q02952 1782 aa15.94■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 TAF5LO75529 589 aa15.94■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 HOXB7P09629 217 aa15.94■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 KIF3AQ9Y496 699 aa15.94■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa15.94■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 CYP21A2P08686 494 aa15.93■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 TTLL5Q6EMB2 1281 aa15.93■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 BIN1O00499 593 aa15.93■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 TAF7LQ5H9L4 462 aa15.93■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 MRVI1Q9Y6F6 885 aa15.93■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 PXDNQ92626 1479 aa15.93■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 KCNF1Q9H3M0 494 aa15.92■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 V9GYY5 206 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 TMEM87AQ8NBN3 555 aa15.92■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 SDF4Q9BRK5 362 aa15.92■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 TM6SF1Q9BZW5 370 aa15.92■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 ARID5BQ14865 1188 aa15.91■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 CLIP2Q9UDT6 1046 aa15.91■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa15.91■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 GJB4Q9NTQ9 266 aa15.91■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 A1BGP04217 495 aa15.91■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 MTX1Q13505 466 aa15.91■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 PDIA6Q15084 440 aa15.91■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 PGBD1Q96JS3 809 aa15.91■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa15.9■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 TTLL7Q6ZT98 887 aa15.9■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 SLC52A2Q9HAB3 445 aa15.9■□□□□ 0.14
VHL-201ENST00000256474 APPP05067 770 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms