RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 CENPFP49454 3210 aa22.14■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.14■■□□□ 1.14
SPCS1-201ENST00000233025 RAD17O75943 681 aa22.14■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.14■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.14■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.14■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.14■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 BRCA2P51587 3418 aa22.14■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.13■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.13■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 MICALL2Q8IY33 904 aa22.13■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.13■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 TAF1P21675 1872 aa22.13■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.12■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 TNIP1Q15025 636 aa22.12■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 YDJCA8MPS7 323 aa22.11■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.1■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.1■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 ADM5C9JUS6 153 aa22.1■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 H7C1D1 291 aa22.1■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 EGFRP00533 1210 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.09■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 ABCC4O15439 1325 aa22.08■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.08■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 NTSR2O95665 410 aa22.08■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 SUSD4Q5VX71 490 aa22.08■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.08■■□□□ 1.13
SPCS1-201ENST00000233025 GPTP24298 496 aa22.07■■□□□ 1.12
SPCS1-201ENST00000233025 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SPCS1-201ENST00000233025 DPF2Q92785 391 aa22.07■■□□□ 1.12
SPCS1-201ENST00000233025 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SPCS1-201ENST00000233025 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.07■■□□□ 1.12
SPCS1-201ENST00000233025 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.07■■□□□ 1.12
SPCS1-201ENST00000233025 SCN9AQ15858 1988 aa22.07■■□□□ 1.12
SPCS1-201ENST00000233025 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SPCS1-201ENST00000233025 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SPCS1-201ENST00000233025 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.05■■□□□ 1.12
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.04■■□□□ 1.12
SPCS1-201ENST00000233025 MPNDQ8N594 471 aa22.04■■□□□ 1.12
SPCS1-201ENST00000233025 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.04■■□□□ 1.12
SPCS1-201ENST00000233025 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SPCS1-201ENST00000233025 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.03■■□□□ 1.12
SPCS1-201ENST00000233025 SP8Q8IXZ3 490 aa22.03■■□□□ 1.12
SPCS1-201ENST00000233025 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SPCS1-201ENST00000233025 PSMD14O00487 310 aa22.02■■□□□ 1.12
SPCS1-201ENST00000233025 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SPCS1-201ENST00000233025 NGEFQ8N5V2 710 aa22.02■■□□□ 1.12
SPCS1-201ENST00000233025 NLRP3Q96P20 1036 aa22.02■■□□□ 1.12
SPCS1-201ENST00000233025 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.02■■□□□ 1.12
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D8O95759 1140 aa22.01■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 PSME4Q14997 1843 aa22.01■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 KIF6Q6ZMV9 814 aa22■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 MCM10Q7L590 875 aa22■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 CDCA5Q96FF9 252 aa22■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 GGA3Q9NZ52 723 aa22■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 GPR25O00155 361 aa21.99■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 BBOX1O75936 387 aa21.99■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.99■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 PRKAR2BP31323 418 aa21.98■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 SULF1Q8IWU6 871 aa21.98■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 RTL9Q8NET4 1388 aa21.98■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.98■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 POTEFA5A3E0 1075 aa21.97■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 RPS12P25398 132 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa21.97■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.97■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.97■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 FKBP1BP68106 108 aa21.96■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0C4DFX4 3053 aa21.95■■□□□ 1.11
SPCS1-201ENST00000233025 PARP10Q53GL7 1025 aa21.95■■□□□ 1.1
SPCS1-201ENST00000233025 DBNDD1Q9H9R9 158 aa21.95■■□□□ 1.1
SPCS1-201ENST00000233025 DCTN1Q14203 1278 aa21.94■■□□□ 1.1
SPCS1-201ENST00000233025 LAMB1P07942 1786 aa21.94■■□□□ 1.1
SPCS1-201ENST00000233025 TM4SF4P48230 202 aa21.93■■□□□ 1.1
SPCS1-201ENST00000233025 GRAPQ13588 217 aa21.93■■□□□ 1.1
SPCS1-201ENST00000233025 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SPCS1-201ENST00000233025 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SPCS1-201ENST00000233025 CFHR5Q9BXR6 569 aa21.93■■□□□ 1.1
SPCS1-201ENST00000233025 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SPCS1-201ENST00000233025 COL4A1P02462 1669 aa21.92■■□□□ 1.1
SPCS1-201ENST00000233025 FKTNO75072 461 aa21.92■■□□□ 1.1
SPCS1-201ENST00000233025 MYL6BP14649 208 aa21.92■■□□□ 1.1
SPCS1-201ENST00000233025 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SPCS1-201ENST00000233025 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.92■■□□□ 1.1
SPCS1-201ENST00000233025 KCNQ5Q9NR82 932 aa21.92■■□□□ 1.1
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF609O15014 1411 aa21.91■■□□□ 1.1
SPCS1-201ENST00000233025 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
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