RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 CHD4Q14839 1912 aa27.49■■□□□ 1.99
SLC25A39-201ENST00000225308 GRIN3BO60391 1043 aa27.49■■□□□ 1.99
SLC25A39-201ENST00000225308 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
SLC25A39-201ENST00000225308 CLUAP1Q96AJ1 413 aa27.49■■□□□ 1.99
SLC25A39-201ENST00000225308 CTSWP56202 376 aa27.48■■□□□ 1.99
SLC25A39-201ENST00000225308 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
SLC25A39-201ENST00000225308 USP44Q9H0E7 712 aa27.48■■□□□ 1.99
SLC25A39-201ENST00000225308 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa27.47■■□□□ 1.99
SLC25A39-201ENST00000225308 C7orf43Q8WVR3 580 aa27.47■■□□□ 1.99
SLC25A39-201ENST00000225308 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
SLC25A39-201ENST00000225308 TTLL11Q8NHH1 800 aa27.46■■□□□ 1.99
SLC25A39-201ENST00000225308 C21orf2O43822 256 aa27.45■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC152Q4G0S7 254 aa27.45■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 RLBP1P12271 317 aa27.43■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 FOXO4P98177 505 aa27.43■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 GRAPQ13588 217 aa27.43■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 EPHA10Q5JZY3 1008 aa27.43■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 KAZALD1Q96I82 304 aa27.43■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 SEC31BQ9NQW1 1179 aa27.43■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 LRRC37AA6NMS7 1700 aa27.43■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 SBF1O95248 1867 aa27.42■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 OLFM4Q6UX06 510 aa27.42■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC51AQ86UW1 340 aa27.42■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 SUCLG2Q96I99 432 aa27.42■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 RTL9Q8NET4 1388 aa27.42■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 CSF1RP07333 972 aa27.41■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 TMEM57Q8N5G2 664 aa27.41■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 GREM2Q9H772 168 aa27.41■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 SNED1Q8TER0 1413 aa27.41■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 SPEF2Q9C093 1822 aa27.41■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa27.4■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa27.4■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 PLIN1O60240 522 aa27.39■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 BBOX1O75936 387 aa27.39■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM161AQ3B820 660 aa27.39■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 MEIS3Q99687 375 aa27.39■■□□□ 1.98
SLC25A39-201ENST00000225308 NFKBIEO00221 500 aa27.38■■□□□ 1.97
SLC25A39-201ENST00000225308 SOGA3Q5TF21 947 aa27.38■■□□□ 1.97
SLC25A39-201ENST00000225308 LMBR1LQ6UX01 489 aa27.38■■□□□ 1.97
SLC25A39-201ENST00000225308 RPS8P62241 208 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC93Q567U6 631 aa27.37■■□□□ 1.97
SLC25A39-201ENST00000225308 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
SLC25A39-201ENST00000225308 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa27.37■■□□□ 1.97
SLC25A39-201ENST00000225308 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
SLC25A39-201ENST00000225308 PANK1Q8TE04 598 aa27.36■■□□□ 1.97
SLC25A39-201ENST00000225308 ITGA6P23229 1130 aa27.35■■□□□ 1.97
SLC25A39-201ENST00000225308 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
SLC25A39-201ENST00000225308 RASSF7Q02833 373 aa27.34■■□□□ 1.97
SLC25A39-201ENST00000225308 TMC4Q7Z404 712 aa27.34■■□□□ 1.97
SLC25A39-201ENST00000225308 ANKRD44Q8N8A2 993 aa27.34■■□□□ 1.97
SLC25A39-201ENST00000225308 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa27.34■■□□□ 1.97
SLC25A39-201ENST00000225308 SP8Q8IXZ3 490 aa27.34■■□□□ 1.97
SLC25A39-201ENST00000225308 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
SLC25A39-201ENST00000225308 LTBP1Q14766 1721 aa27.33■■□□□ 1.97
SLC25A39-201ENST00000225308 ITPRIPQ8IWB1 547 aa27.33■■□□□ 1.97
SLC25A39-201ENST00000225308 CHMP3Q9Y3E7 222 aa27.33■■□□□ 1.97
SLC25A39-201ENST00000225308 LTBP3Q9NS15 1303 aa27.32■■□□□ 1.96
SLC25A39-201ENST00000225308 MS4A1P11836 297 aa27.32■■□□□ 1.96
SLC25A39-201ENST00000225308 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa27.32■■□□□ 1.96
SLC25A39-201ENST00000225308 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
SLC25A39-201ENST00000225308 GNAI3P08754 354 aa27.31■■□□□ 1.96
SLC25A39-201ENST00000225308 PRELPP51888 382 aa27.31■■□□□ 1.96
SLC25A39-201ENST00000225308 RTKN2Q8IZC4 609 aa27.31■■□□□ 1.96
SLC25A39-201ENST00000225308 TAOK3Q9H2K8 898 aa27.31■■□□□ 1.96
SLC25A39-201ENST00000225308 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
SLC25A39-201ENST00000225308 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
SLC25A39-201ENST00000225308 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
SLC25A39-201ENST00000225308 DUOX1Q9NRD9 1551 aa27.3■■□□□ 1.96
SLC25A39-201ENST00000225308 C20orf194Q5TEA3 1177 aa27.3■■□□□ 1.96
SLC25A39-201ENST00000225308 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa27.29■■□□□ 1.96
SLC25A39-201ENST00000225308 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP27.28■■□□□ 1.962e-6■■■□□ 15.6
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC57Q2TAC2 916 aa27.28■■□□□ 1.96
SLC25A39-201ENST00000225308 GRIPAP1Q4V328 841 aa27.28■■□□□ 1.96
SLC25A39-201ENST00000225308 PSMD1Q99460 953 aa27.28■■□□□ 1.96
SLC25A39-201ENST00000225308 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
SLC25A39-201ENST00000225308 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
SLC25A39-201ENST00000225308 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
SLC25A39-201ENST00000225308 PDE3AQ14432 1141 aa27.27■■□□□ 1.96
SLC25A39-201ENST00000225308 HDAC5Q9UQL6 1122 aa27.27■■□□□ 1.96
SLC25A39-201ENST00000225308 A0A1B0GUL6 1792 aa27.27■■□□□ 1.96
SLC25A39-201ENST00000225308 LMNB1P20700 586 aa27.26■■□□□ 1.95
SLC25A39-201ENST00000225308 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
SLC25A39-201ENST00000225308 RRP1P56182 461 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
SLC25A39-201ENST00000225308 MVPQ14764 893 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
SLC25A39-201ENST00000225308 COG6Q9Y2V7 657 aa27.26■■□□□ 1.95
SLC25A39-201ENST00000225308 TIAM2Q8IVF5 1701 aa27.26■■□□□ 1.95
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
SLC25A39-201ENST00000225308 C9orf131Q5VYM1 1079 aa27.24■■□□□ 1.95
SLC25A39-201ENST00000225308 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
SLC25A39-201ENST00000225308 MPNDQ8N594 471 aa27.24■■□□□ 1.95
SLC25A39-201ENST00000225308 MPHOSPH8Q99549 860 aa27.24■■□□□ 1.95
SLC25A39-201ENST00000225308 GNAI2P04899 355 aa27.23■■□□□ 1.95
SLC25A39-201ENST00000225308 GPSM2P81274 684 aa27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms