RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000204005.13

LTBP4-201, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTBP4, Length 5,032 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-201ENST00000204005 SLAIN2Q9P270 581 aa22.15■■□□□ 1.14
LTBP4-201ENST00000204005 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.15■■□□□ 1.14
LTBP4-201ENST00000204005 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.14■■□□□ 1.14
LTBP4-201ENST00000204005 KIAA0232Q92628 1395 aa22.14■■□□□ 1.14
LTBP4-201ENST00000204005 BRF1Q92994 677 aa22.14■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 ANO10Q9NW15 660 aa22.14■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 NYXQ9GZU5 481 aa22.14■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 PLA2R1Q13018 1463 aa22.14■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.14■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 CCDC66A2RUB6 948 aa22.14■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 ADCY5O95622 1261 aa22.14■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 ZNF76P36508 570 aa22.14■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.14■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.13■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.13■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.13■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 MICU3Q86XE3 530 aa22.13■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.138e-7■■■□□ 18.8
LTBP4-201ENST00000204005 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.12■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.12■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 SHROOM2Q13796 1616 aa22.12■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 CTAGE5O15320 804 aa22.12■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.12■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.12■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 TSPY2A6NKD2 308 aa22.12■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 KIF5BP33176 963 aa22.12■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 GSTO1P78417 241 aa22.12■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 TFCP2Q12800 502 aa22.12■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 USP19O94966 1318 aa22.11■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 CYP7A1P22680 504 aa22.11■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.11■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 SYNMO15061 1565 aa22.11■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.11■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 RUFY1Q96T51 708 aa22.11■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.1■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 KRT23Q9C075 422 aa22.1■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 ATP7BP35670 1465 aa22.1■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 KIF1BO60333 1816 aa22.1■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 CHMLP26374 656 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 NLRP5P59047 1200 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 CCDC96Q2M329 555 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 CAGE1Q8TC20 777 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 USP26Q9BXU7 913 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 NLRP1Q9C000 1473 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 RAD50Q92878 1312 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 PTPN14Q15678 1187 aa22.08■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.08■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 TET3O43151 1660 aa22.08■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 ABCC3O15438 1527 aa22.08■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.134e-8■□□□□ 10.6
LTBP4-201ENST00000204005 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.08■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
LTBP4-201ENST00000204005 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
LTBP4-201ENST00000204005 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.08■■□□□ 1.12
LTBP4-201ENST00000204005 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-201ENST00000204005 TMTC2Q8N394 836 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-201ENST00000204005 NECAB1Q8N987 351 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-201ENST00000204005 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-201ENST00000204005 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-201ENST00000204005 KAT14Q9H8E8 782 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-201ENST00000204005 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-201ENST00000204005 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-201ENST00000204005 WTAPQ15007 396 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-201ENST00000204005 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-201ENST00000204005 USP48Q86UV5 1035 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-201ENST00000204005 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-201ENST00000204005 ODF2Q5BJF6 829 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBP4-201ENST00000204005 FSIP1Q8NA03 581 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBP4-201ENST00000204005 ESR2Q92731 530 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBP4-201ENST00000204005 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
LTBP4-201ENST00000204005 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
LTBP4-201ENST00000204005 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
LTBP4-201ENST00000204005 RAB34Q9BZG1 259 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBP4-201ENST00000204005 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
LTBP4-201ENST00000204005 CFAP100Q494V2 611 aa22.05■■□□□ 1.12
LTBP4-201ENST00000204005 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
LTBP4-201ENST00000204005 EYA2O00167 538 aa22.05■■□□□ 1.12
LTBP4-201ENST00000204005 HLA-DOAP06340 250 aa22.05■■□□□ 1.12
LTBP4-201ENST00000204005 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
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