RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000005558.8

IFRD1-201, Transcript of interferon related developmental regulator 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IFRD1, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1-201ENST00000005558 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.63■■□□□ 1.37
IFRD1-201ENST00000005558 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
IFRD1-201ENST00000005558 BACH2Q9BYV9 841 aa23.63■■□□□ 1.37
IFRD1-201ENST00000005558 BCL11AQ9H165 835 aa23.63■■□□□ 1.37
IFRD1-201ENST00000005558 ABCC12Q96J65 1359 aa23.63■■□□□ 1.37
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IFRD1-201ENST00000005558 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
IFRD1-201ENST00000005558 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
IFRD1-201ENST00000005558 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.63■■□□□ 1.37
IFRD1-201ENST00000005558 SLC10A5Q5PT55 438 aa23.62■■□□□ 1.37
IFRD1-201ENST00000005558 OSBPL3Q9H4L5 887 aa23.62■■□□□ 1.37
IFRD1-201ENST00000005558 TM4SF1P30408 202 aa23.61■■□□□ 1.37
IFRD1-201ENST00000005558 PDE1AP54750 535 aa23.61■■□□□ 1.37
IFRD1-201ENST00000005558 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
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IFRD1-201ENST00000005558 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.61■■□□□ 1.37
IFRD1-201ENST00000005558 SETDB2Q96T68 719 aa23.61■■□□□ 1.37
IFRD1-201ENST00000005558 STAP2Q9UGK3 403 aa23.61■■□□□ 1.37
IFRD1-201ENST00000005558 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.6■■□□□ 1.37
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IFRD1-201ENST00000005558 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
IFRD1-201ENST00000005558 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.6■■□□□ 1.37
IFRD1-201ENST00000005558 LRP5O75197 1615 aa23.6■■□□□ 1.37
IFRD1-201ENST00000005558 ITGA6P23229 1130 aa23.59■■□□□ 1.37
IFRD1-201ENST00000005558 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.59■■□□□ 1.37
IFRD1-201ENST00000005558 TAF1P21675 1872 aa23.59■■□□□ 1.37
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IFRD1-201ENST00000005558 TFCP2Q12800 502 aa23.58■■□□□ 1.37
IFRD1-201ENST00000005558 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.58■■□□□ 1.37
IFRD1-201ENST00000005558 TTC22Q5TAA0 569 aa23.58■■□□□ 1.37
IFRD1-201ENST00000005558 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.57■■□□□ 1.36
IFRD1-201ENST00000005558 CIAO1O76071 339 aa23.57■■□□□ 1.36
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IFRD1-201ENST00000005558 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.57■■□□□ 1.36
IFRD1-201ENST00000005558 RTL9Q8NET4 1388 aa23.57■■□□□ 1.36
IFRD1-201ENST00000005558 MX1P20591 662 aa23.56■■□□□ 1.36
IFRD1-201ENST00000005558 DDR1Q08345 913 aa23.56■■□□□ 1.36
IFRD1-201ENST00000005558 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
IFRD1-201ENST00000005558 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.56■■□□□ 1.36
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IFRD1-201ENST00000005558 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.56■■□□□ 1.36
IFRD1-201ENST00000005558 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.55■■□□□ 1.36
IFRD1-201ENST00000005558 PI4K2BQ8TCG2 481 aa23.55■■□□□ 1.36
IFRD1-201ENST00000005558 NYXQ9GZU5 481 aa23.54■■□□□ 1.36
IFRD1-201ENST00000005558 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.54■■□□□ 1.36
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IFRD1-201ENST00000005558 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
IFRD1-201ENST00000005558 SLC15A2Q16348 729 aa23.54■■□□□ 1.36
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IFRD1-201ENST00000005558 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
IFRD1-201ENST00000005558 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.52■■□□□ 1.36
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IFRD1-201ENST00000005558 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.51■■□□□ 1.35
IFRD1-201ENST00000005558 SDSP20132 328 aa23.5■■□□□ 1.35
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IFRD1-201ENST00000005558 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.49■■□□□ 1.35
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IFRD1-201ENST00000005558 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
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IFRD1-201ENST00000005558 ZNF609O15014 1411 aa23.48■■□□□ 1.35
IFRD1-201ENST00000005558 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.48■■□□□ 1.35
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IFRD1-201ENST00000005558 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
IFRD1-201ENST00000005558 NLRP3Q96P20 1036 aa23.45■■□□□ 1.34
IFRD1-201ENST00000005558 STK32BQ9NY57 414 aa23.45■■□□□ 1.34
IFRD1-201ENST00000005558 MSH5O43196 834 aa23.45■■□□□ 1.34
IFRD1-201ENST00000005558 CCDC125Q86Z20 511 aa23.45■■□□□ 1.34
IFRD1-201ENST00000005558 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.44■■□□□ 1.34
IFRD1-201ENST00000005558 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.43■■□□□ 1.34
IFRD1-201ENST00000005558 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.43■■□□□ 1.34
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