RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, human

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNMT1-208	ENST00000586667	OMP	P47874	163 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	P2RY4	P51582	365 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	FHL1	Q13642	323 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF74	Q16587	644 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	OR10D3	Q8NH80	312 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	RNF217	Q8TC41	542 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	SARAF	Q96BY9	339 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	DDIT4L	Q96D03	193 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	OR5B2	Q96R09	309 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	PSD2	Q9BQI7	771 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	EXO5	Q9H790	373 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	SELENON	Q9NZV5	590 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		11.29	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	GJE1	A6NN92	205 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667		H0Y3Z8	333 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	CDC42EP2	O14613	210 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	BCKDK	O14874	412 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC19A2	O60779	497 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	RAMP1	O60894	148 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	PMS2P2	O95744	297 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	FUT1	P19526	365 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	FPR1	P21462	350 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	CBL	P22681	906 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	PTGS2	P35354	604 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	IDUA	P35475	653 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	GCK	P35557	465 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	DIO1	P49895	249 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	SMIM11A	P58511	58 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	H3F3A	P84243	136 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	PRKCD	Q05655	676 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	GK3P	Q14409	553 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	RTL6	Q6ICC9	239 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	CD163	Q86VB7	1156 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	OR6S1	Q8NH40	331 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	STMN2	Q93045	179 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	MED31	Q9Y3C7	131 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	GTF3C1	Q12789	2109 aa		11.27	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667		B8ZZF3	427 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	CXCL13	O43927	109 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	MGRN1	O60291	552 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	AHSA1	O95433	338 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TSPAN19	P0C672	248 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TFPI	P10646	304 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	IFNA8	P32881	189 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	GPR4	P46093	362 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	FXYD6P3	P58550	94 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TLE1	Q04724	770 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	SRY	Q05066	204 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	MICA	Q29983	383 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	GXYLT1	Q4G148	440 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	HBM	Q6B0K9	141 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61

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