RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528920.5

TSTA3-208, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 964 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-208ENST00000528920 ALG10BQ5I7T1 473 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 PGAM4Q8N0Y7 254 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 ELOA3Q8NG57 546 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 STK35Q8TDR2 534 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 PROX1Q92786 737 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 SLC47A1Q96FL8 570 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 LRRC46Q96FV0 321 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 NSL1Q96IY1 281 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 MCHR1Q99705 422 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 SPOCK3Q9BQ16 436 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 ADA2Q9NZK5 511 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 EMC9Q9Y3B6 208 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 A0A0B4J2E0 115 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 A0A1B0GX12 115 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 A8MXE2 369 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 CYTIPO60759 359 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 CD8BP10966 210 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 AGTR1P30556 359 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 IDUAP35475 653 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 SLC35A1P78382 337 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 H3F3AP84243 136 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 SLC25A3Q00325 362 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 C1orf140Q5VVS0 124 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF613Q6PF04 617 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 C16orf89Q6UX73 402 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 LUZP2Q86TE4 346 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 CARM1Q86X55 608 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 OR6K3Q8NGY3 331 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 SLC38A4Q969I6 547 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 PCDHAC1Q9H158 963 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 NDE1Q9NXR1 346 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 SELENONQ9NZV5 590 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 KLHL9Q9P2J3 617 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 KLHL13Q9P2N7 655 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 SH3GLB1Q9Y371 365 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 A0A087WUJ7 227 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 LIPT2A6NK58 231 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 GPIP06744 558 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 COX6B1P14854 86 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 TNFRSF1BP20333 461 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 FPR1P21462 350 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 UQCRC1P31930 480 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 CDH12P55289 794 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 SELENOWP63302 87 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 MXRA7P84157 204 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 EGR4Q05215 589 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 CEACAM7Q14002 265 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 PDK3Q15120 406 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 ENTPD8Q5MY95 495 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 RNF148Q8N7C7 305 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 CDRT15Q96T59 188 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 PSD2Q9BQI7 771 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 BCO1Q9HAY6 547 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 PROCRQ9UNN8 238 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 CSMD1Q96PZ7 3565 aa13.02□□□□□ -0.32
TSTA3-208ENST00000528920 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-208ENST00000528920 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-208ENST00000528920 ERICH4A6NGS2 130 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-208ENST00000528920 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF724A8MTY0 619 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-208ENST00000528920 B2RBV5 119 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF814B7Z6K7 855 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-208ENST00000528920 LYPD3O95274 346 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-208ENST00000528920 AHSA1O95433 338 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-208ENST00000528920 YES1P07947 543 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-208ENST00000528920 T-ENOLP0DO92 83 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-208ENST00000528920 HSD17B1P14061 328 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-208ENST00000528920 NCK1P16333 377 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-208ENST00000528920 GGT1P19440 569 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-208ENST00000528920 CALB2P22676 271 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-208ENST00000528920 CPOXP36551 454 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-208ENST00000528920 PCYT1AP49585 367 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-208ENST00000528920 OR7A5Q15622 319 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-208ENST00000528920 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-208ENST00000528920 TMEM201Q5SNT2 666 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-208ENST00000528920 PAQR6Q6TCH4 344 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-208ENST00000528920 C5orf46Q6UWT4 87 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-208ENST00000528920 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-208ENST00000528920 TUSC5Q8IXB3 177 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-208ENST00000528920 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms