RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	GIMAP5	Q96F15	307 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	EGLN2	Q96KS0	407 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	MUS81	Q96NY9	551 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0A6YYJ9	748 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF264	O43296	627 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	VENTX	O95231	258 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	EGR1	P18146	543 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINF1	P36955	418 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP12A	P54707	1039 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXA1	P55317	472 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	PRPS1	P60891	318 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL26	Q53HC5	615 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SYT14P1	Q58G82	188 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	DCST2	Q5T1A1	773 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	PIGX	Q8TBF5	258 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM234	Q8WY98	164 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX18	Q96RF0	628 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	STAC	Q99469	402 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SOX7	Q9BT81	388 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	PIGU	Q9H490	435 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	REEP4	Q9H6H4	257 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	MALT1	Q9UDY8	824 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511		B9A039	149 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	STAMBP	O95630	424 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT16	P08779	473 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ECI1	P42126	302 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC1A3	P43003	542 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGEA8	P43361	318 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKAA2	P54646	552 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	TP53BP2	Q13625	1128 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	CCNI	Q14094	377 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	PDK3	Q15120	406 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	MST1L	Q2TV78	715 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	9.43	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR31	Q8NA23	367 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	TSSK3	Q96PN8	268 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	VSTM5	A8MXK1	200 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	KLF11	O14901	512 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	TBX1	O43435	398 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT33A	O76009	404 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	CRYAA	P02489	173 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ITGA5	P08648	1049 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4A8	P0C604	315 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	DAO	P14920	347 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	PGC	P20142	388 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	IL2RG	P31785	369 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SESN3	P58005	492 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2B6	P58173	313 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	CFAP157	Q5JU67	520 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF563	Q8TA94	476 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ST8SIA1	Q92185	356 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		9.42	□□□□□ -0.9

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