RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471023.1

NOP56-211, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 592 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-211ENST00000471023 ECSITQ9BQ95 431 aa6.68□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 COQ10BQ9H8M1 238 aa6.68□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.68□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 PNPLA3Q9NST1 481 aa6.68□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 ACER3Q9NUN7 267 aa6.68□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 TAS2R10Q9NYW0 307 aa6.68□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.68□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 IFT52Q9Y366 437 aa6.68□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 MPDZO75970 2070 aa6.68□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 ABCA4P78363 2273 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 ABCA2Q9BZC7 2435 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 MED12LQ86YW9 2145 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 DOCK7Q96N67 2140 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 A0A0J9YW62 118 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 ACOT8O14734 319 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 GMFGO60234 142 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 NPIPB7O75200 414 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 TRAPPC6AO75865 159 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 PRSS23O95084 383 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 ACTL6AO96019 429 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 C8BP07358 591 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 NCK1P16333 377 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 IL7RP16871 459 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 ZNF17P17021 662 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 KLK2P20151 261 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 TNFRSF1BP20333 461 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 CLK3P49761 638 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 CBX1P83916 185 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 HPCAP84074 193 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 PMPCAQ10713 525 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 GNA13Q14344 377 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.346e-22■■■□□ 15.5
NOP56-211ENST00000471023 CDSNQ15517 529 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 BCL2A1Q16548 175 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 CYBRD1Q53TN4 286 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 PLXDC2Q6UX71 529 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 CBLL1Q75N03 491 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 ASRGL1Q7L266 308 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 SLC30A8Q8IWU4 369 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 PEX5LQ8IYB4 626 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 ZNF614Q8N883 585 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 LSMEM1Q8N8F7 131 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 OR52E4Q8NGH9 312 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 OR6T1Q8NGN1 323 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 ST8SIA1Q92185 356 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 C3orf49Q96BT1 292 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 RNF145Q96MT1 663 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 ZNF559Q9BR84 538 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 PINK1Q9BXM7 581 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 GORASP2Q9H8Y8 452 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 B4GALT7Q9UBV7 327 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 OSGIN1Q9UJX0 560 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 ANGPT4Q9Y264 503 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 VDAC3Q9Y277 283 aa6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 NF1P21359 2839 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 CFAP73A6NFT4 308 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 C5orf58C9J3I9 102 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 NPIPA2E9PIF3 369 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 NPIPA3F8WFD2 350 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 H3BNH8 94 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 C19orf84I3L1E1 186 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 M0R3H8 397 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 CXCR6O00574 342 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 FFAR1O14842 300 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 ADAMDEC1O15204 470 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 FESP07332 822 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 GABRA1P14867 456 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 HPGDP15428 266 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 IGFBP2P18065 325 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 ATP6V1B2P21281 511 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 ACVR2AP27037 513 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 SLC1A3P43003 542 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 IDH2P48735 452 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 NCALDP61601 193 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 SELENOWP63302 87 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 EGR4Q05215 589 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 EGR3Q06889 387 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 CBFBQ13951 182 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 GUSBP1Q15486 140 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 SPATS1Q496A3 300 aa6.66□□□□□ -1.34
NOP56-211ENST00000471023 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
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