RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272638.13

UBXN4-201, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN4, Length 4,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM69Q5SWH9 247 aa11.56□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 SFXN4Q6P4A7 337 aa11.56□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa11.56□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 ITPKCQ96DU7 683 aa11.56□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 NUDT22Q9BRQ3 303 aa11.56□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 SCN8AQ9UQD0 1980 aa11.56□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 AHSA1O95433 338 aa11.56□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 TACR3P29371 465 aa11.56□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 SSTR2P30874 369 aa11.56□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa11.56□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 C17orf47Q8NEP4 570 aa11.56□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 FBLIM1Q8WUP2 373 aa11.56□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF681Q96N22 645 aa11.56□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 SRRQ9GZT4 340 aa11.56□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 SLC25A19Q9HC21 320 aa11.56□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa11.56□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 COQ3Q9NZJ6 369 aa11.56□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 PLXNA3P51805 1871 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 DCDC2BA2VCK2 349 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 SERINC4A6NH21 518 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 GPANK1O95872 356 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 RECKO95980 971 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 TACSTD2P09758 323 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 SLC35E2P0CK97 266 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 UBL4AP11441 157 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 TAS2R43P59537 309 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 KIAA1024LP59773 190 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 DMRTC1Q5HYR2 192 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 TRIM63Q969Q1 353 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 DUSP22Q9NRW4 184 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 DPM1O60762 260 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 FZD7O75084 574 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 SYPP08247 313 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 GIMD1P0DJR0 217 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 FBLP22087 321 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 DUSP8Q13202 625 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 CLDN22Q8N7P3 220 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 NOX4Q9NPH5 578 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 IL20Q9NYY1 176 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 RORAP35398 523 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 YPEL5P62699 121 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 ACTC1P68032 377 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 ACTA1P68133 377 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 FAM69BQ5VUD6 431 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 OR7E24Q6IFN5 339 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 FAAP20Q6NZ36 180 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 MARCH3Q86UD3 253 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 MS4A15Q8N5U1 240 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 LGALS14Q8TCE9 139 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 DUSP19Q8WTR2 217 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 GPER1Q99527 375 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 PLCL2Q9UPR0 1127 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 DTX4Q9Y2E6 619 aa11.55□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 A0A1B0GTH9 108 aa11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 H0YC42 278 aa11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 SLC16A7O60669 478 aa11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 SLC19A2O60779 497 aa11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 LIPCP11150 499 aa11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 HTR2BP41595 481 aa11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP11.54□□□□□ -0.564e-7■■□□□ 13.6
UBXN4-201ENST00000272638 MELKQ14680 651 aa11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 WDR88Q6ZMY6 472 aa11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 NUP54Q7Z3B4 507 aa11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 PDCD10Q9BUL8 212 aa11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 ALG12Q9BV10 488 aa11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 SEMA6CQ9H3T2 930 aa11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 EVA1BQ9NVM1 165 aa11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 KLF15Q9UIH9 416 aa11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 STOMP27105 288 aa11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 CD1CP29017 333 aa11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 KIR2DL3P43628 341 aa11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 HTR3AP46098 478 aa11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 PRKXP51817 358 aa11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 TPBGQ13641 420 aa11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 QSOX2Q6ZRP7 698 aa11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 NOXA1Q86UR1 476 aa11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 ARHGDIGQ99819 225 aa11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 CUTCQ9NTM9 273 aa11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 CKLFQ9UBR5 152 aa11.54□□□□□ -0.56
UBXN4-201ENST00000272638 GMEB2Q9UKD1 530 aa11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.1 ms