RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	NELFA	Q9H3P2	528 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	AHSP	Q9NZD4	102 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A087WV62	115 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	PCDH7	O60245	1069 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	CDC14B	O60729	498 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	COQ9	O75208	318 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	GUCY1B2	O75343	617 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	FBXO24	O75426	580 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	LGI1	O95970	557 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	TF	P02787	698 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	NPR2	P20594	1047 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	GP5	P40197	560 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCNG1	P51959	295 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRKAG1	P54619	331 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	CDH13	P55290	713 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRPS1	P60891	318 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	MYBPC1	Q00872	1141 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	BTK	Q06187	659 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	CASP12	Q6UXS9	341 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPATC1	Q76KD6	591 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	PHF21B	Q96EK2	531 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	NTN4	Q9HB63	628 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	MMP26	Q9NRE1	261 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	PCTP	Q9UKL6	214 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	FZR1	Q9UM11	496 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	CACNG2	Q9Y698	323 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	TENM2	Q9NT68	2774 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	SULT2B1	O00204	365 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLITRK5	O94991	958 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR4F21	O95013	312 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	KCNH1	O95259	989 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	KNG1	P01042	644 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	NGFR	P08138	427 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	MPI	P34949	423 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC1A3	P43003	542 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAGEB1	P43366	347 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	PSPH	P78330	225 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	LCN2	P80188	198 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	IFT88	Q13099	833 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	SELENBP1	Q13228	472 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	QPRT	Q15274	297 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	PPP1R7	Q15435	360 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM189A2	Q15884	450 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRT80	Q6KB66	452 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	RAPH1	Q70E73	1250 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	SSX8	Q7RTT4	187 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	UBE2F	Q969M7	185 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	SYT3	Q9BQG1	590 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23

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