RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, human

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNMT1-208	ENST00000586667	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	POLE	Q07864	2286 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	RELN	P78509	3460 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667		A0A087WUJ7	227 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	SUSD5	O60279	629 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	PRB1	P04280	392 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	PEPD	P12955	493 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF708	P17019	499 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	BMP7	P18075	431 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	CHM	P24386	653 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	HTR3A	P46098	478 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	UGT2B15	P54855	530 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	MLLT10	P55197	1068 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	CLDN20	P56880	219 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	C3AR1	Q16581	482 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	VASN	Q6EMK4	673 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	P3H2	Q8IVL5	708 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	NTN4	Q9HB63	628 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DNMT1-208	ENST00000586667		H3BML4	177 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF208	O43345	1280 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	PIP5K1C	O60331	668 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	PNMT	P11086	282 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ITGA2	P17301	1181 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	RRM2	P31350	389 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	STAR	P49675	285 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	IST1	P53990	364 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	RAC1	P63000	192 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	SPIB	Q01892	262 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ATP6AP1	Q15904	470 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	SYT14P1	Q58G82	188 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	OR2T29	Q8NH02	315 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	MPP4	Q96JB8	637 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ARL5B	Q96KC2	179 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF347	Q96SE7	839 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	S100A14	Q9HCY8	104 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	AP4S1	Q9Y587	144 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	FLNC	Q14315	2725 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667		A0A087WUU8	490 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667		A0A1B0GTH9	108 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	TTLL8	A6PVC2	850 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	LINC01387	J3KSC0	135 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ADAMDEC1	O15204	470 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ACTL6A	O96019	429 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	OPN1LW	P04000	364 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	KLK2	P20151	261 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	CCNA2	P20248	432 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	HMGA2	P52926	109 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ST3GAL3	Q11203	375 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	TRAM2	Q15035	370 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	EMC4	Q5J8M3	183 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	AAGAB	Q6PD74	315 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF843	Q8N446	348 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	ELOA3	Q8NG57	546 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DNMT1-208	ENST00000586667	PFN4	Q8NHR9	129 aa		11.32	□□□□□ -0.6

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