RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	BCO1	Q9HAY6	547 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF225	Q9UK10	706 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	PDPK1	O15530	556 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	RAD51C	O43502	376 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNK2	O95069	426 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	NKX2-2	O95096	273 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ALOX5	P09917	674 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	COX5A	P20674	150 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	CCR4	P51679	360 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	RAC3	P60763	192 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTG1	P63261	375 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF117	Q03924	483 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	SELENBP1	Q13228	472 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	CD226	Q15762	336 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF385B	Q569K4	471 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF614	Q8N883	585 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF527	Q8NB42	609 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5B2	Q96R09	309 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF382	Q96SR6	550 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB17	Q9H0T7	212 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	GIN1	Q9NXP7	522 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	EMC3	Q9P0I2	261 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	NTM	Q9P121	344 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	TIMM22	Q9Y584	194 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PQD3	144 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	CRCP	O75575	148 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	PGM3	O95394	542 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	LCN1	P31025	176 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	9.49	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	P2RX1	P51575	399 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	PHC1	P78364	1004 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	GUCY2D	Q02846	1103 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	DUSP5	Q16690	384 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	C3orf56	Q8N813	242 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	APH1A	Q96BI3	265 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ASB6	Q9NWX5	421 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	9.49	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF724	A8MTY0	619 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	VWC2L	B2RUY7	222 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA8R	I6L899	631 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	CYTIP	O60759	359 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	HSPA4L	O95757	839 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	NPIPA8	P0DM63	369 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ACP2	P11117	423 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	CREB1	P16220	341 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF23	P17027	643 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	EDNRA	P25101	427 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINB9	P50453	376 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	PKNOX1	P55347	436 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	C2orf54	Q08AI8	447 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	UNC50	Q53HI1	259 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	CBLN3	Q6UW01	205 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	RINL	Q6ZS11	566 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		9.48	□□□□□ -0.89

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