RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 NME2P22392 152 aa10.45□□□□□ -0.74
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CAPNS1-209ENST00000590049 OR52E4Q8NGH9 312 aa10.44□□□□□ -0.74
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CAPNS1-209ENST00000590049 C1orf159Q96HA4 380 aa10.44□□□□□ -0.74
CAPNS1-209ENST00000590049 ADOQ96SZ5 270 aa10.44□□□□□ -0.74
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC38A1Q9H2H9 487 aa10.44□□□□□ -0.74
CAPNS1-209ENST00000590049 CXorf56Q9H5V9 222 aa10.44□□□□□ -0.74
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CAPNS1-209ENST00000590049 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
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CAPNS1-209ENST00000590049 V9GYQ6 96 aa10.44□□□□□ -0.74
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CAPNS1-209ENST00000590049 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa10.43□□□□□ -0.74
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CAPNS1-209ENST00000590049 FCMRO60667 390 aa10.43□□□□□ -0.74
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CAPNS1-209ENST00000590049 SLC25A12O75746 678 aa10.43□□□□□ -0.74
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CAPNS1-209ENST00000590049 ETFDHQ16134 617 aa10.43□□□□□ -0.74
CAPNS1-209ENST00000590049 ZSWIM7Q19AV6 140 aa10.43□□□□□ -0.74
CAPNS1-209ENST00000590049 FCRLBQ6BAA4 426 aa10.43□□□□□ -0.74
CAPNS1-209ENST00000590049 ZFP1Q6P2D0 407 aa10.43□□□□□ -0.74
CAPNS1-209ENST00000590049 CBLL1Q75N03 491 aa10.43□□□□□ -0.74
CAPNS1-209ENST00000590049 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
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