RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 NID1P14543 1247 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 ME2P23368 584 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 CARD18P57730 90 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 BEX5Q5H9J7 111 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 COQ5Q5HYK3 327 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 ANXA8L1Q5VT79 327 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 CDC73Q6P1J9 531 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 PRSS57Q6UWY2 283 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 BEND4Q6ZU67 534 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 OLIG3Q7RTU3 272 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 PRIMA1Q86XR5 153 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 CLECL1Q8IZS7 167 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 ZNF619Q8N2I2 560 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 DPP10Q8N608 796 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 OR5AK3PQ8NH89 298 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 GTF2H4Q92759 462 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 CCDC115Q96NT0 180 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 INPP5KQ9BT40 448 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 PIGUQ9H490 435 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 ATAD3AQ9NVI7 634 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 BTNL2Q9UIR0 455 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 CSPG4Q6UVK1 2322 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 JMJD1CQ15652 2540 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 ERICH4A6NGS2 130 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 B2RBV5 119 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 FXYD1O00168 92 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 AIM2O14862 343 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 C6orf47O95873 294 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 DDX5P17844 614 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 CCT3P49368 545 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 NUDT2P50583 147 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 NR1H2P55055 460 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 NCALDP61601 193 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 TP53BP2Q13625 1128 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 MLC1Q15049 377 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 MMEL1Q495T6 779 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 KLHL26Q53HC5 615 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 DCST2Q5T1A1 773 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 RINLQ6ZS11 566 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 MISPQ8IVT2 679 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 TUSC5Q8IXB3 177 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 ZNF614Q8N883 585 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 RNF128Q8TEB7 428 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 NEUROG1Q92886 237 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 S100PBPQ96BU1 408 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 ITCHQ96J02 903 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 STACQ99469 402 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 BDH2Q9BUT1 245 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 GSX2Q9BZM3 304 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 EFCAB1Q9HAE3 211 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 DUSP22Q9NRW4 184 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 GPATCH2Q9NW75 528 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 SLAMF8Q9P0V8 285 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 A0A096LPI6 279 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 INAFM1C9JVW0 142 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 HS3ST1O14792 307 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 PPP3CBP16298 524 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 ATP6V1C1P21283 382 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 LCN1P31025 176 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 CDKN2CP42773 168 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 P2RX1P51575 399 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 MNAT1P51948 309 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 RPS26P62854 115 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 NFYCQ13952 458 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 SPDYE7PQ495Y7 208 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 GTDC1Q4AE62 458 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 C6orf10Q5SRN2 563 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 PDSS1Q5T2R2 415 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 DLEU7Q6UYE1 221 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 TFAP2EQ6VUC0 442 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 HACD2Q6Y1H2 254 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 DHDDSQ86SQ9 333 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 STK32CQ86UX6 486 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 MSRB3Q8IXL7 192 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 CLEC4FQ8N1N0 589 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 NATD1Q8N6N6 113 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 OR5D16Q8NGK9 328 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 GPR119Q8TDV5 335 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 TMEM171Q8WVE6 324 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 OR5P2Q8WZ92 322 aa11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.8 ms