RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	JADE3	Q92613	823 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	TENM3	Q9P273	2699 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF716	A6NP11	495 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ALG1L2	C9J202	215 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	NR5A2	O00482	541 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	PLPP2	O43688	288 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	KERA	O60938	352 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	PSMG1	O95456	288 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ESRRB	O95718	433 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	PDYN	P01213	254 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ADRA2A	P08913	450 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	TSPAN8	P19075	237 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ME2	P23368	584 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRTN3	P24158	256 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	IVD	P26440	423 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAPK1	P28482	360 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ATP6V0D1	P61421	351 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF117	Q03924	483 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZP4	Q12836	540 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRAF3	Q13114	568 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	EFNB3	Q15768	340 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	PFKFB4	Q16877	469 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCDC103	Q8IW40	242 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLITRK2	Q9H156	845 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	GP6	Q9HCN6	339 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	EQTN	Q9NQ60	294 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF69	Q9UC07	566 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF724	A8MTY0	619 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	NCR1	O76036	304 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ACP2	P11117	423 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	PCMT1	P22061	227 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	GCH1	P30793	250 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	PCGF2	P35227	344 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	SEC24C	P53992	1094 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	RAC3	P60763	192 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	PHEX	P78562	749 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	AVPI1	Q5T686	147 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	FRG2	Q64ET8	278 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPATA21	Q7Z572	469 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC43A2	Q8N370	569 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRIM58	Q8NG06	486 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR51F2	Q8NH61	342 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	APH1A	Q96BI3	265 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	FRG2B	Q96QU4	278 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR5B2	Q96R09	309 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	MMP27	Q9H306	513 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ASB6	Q9NWX5	421 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ACOT9	Q9Y305	439 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	COL7A1	Q02388	2944 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	TP73	O15350	636 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	MPZL1	O95297	269 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	CECR9	P0C854	216 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRKCA	P17252	672 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22

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