RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 D6RAR5 112 aa15.77■□□□□ 0.12
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RABGGTA-201ENST00000216840 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
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RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
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RABGGTA-201ENST00000216840 HCAR1Q9BXC0 346 aa15.77■□□□□ 0.11
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RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF117Q03924 483 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGGTA-201ENST00000216840 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.11
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RABGGTA-201ENST00000216840 LINC00299Q6ZSB3 139 aa15.75■□□□□ 0.11
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RABGGTA-201ENST00000216840 EMP2P54851 167 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGGTA-201ENST00000216840 LHFPL3Q86UP9 236 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGGTA-201ENST00000216840 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
RABGGTA-201ENST00000216840 PHC2Q8IXK0 858 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC37A3Q8NCC5 494 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGGTA-201ENST00000216840 METTL21AQ8WXB1 218 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGGTA-201ENST00000216840 BORCS5Q969J3 196 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGGTA-201ENST00000216840 SH3GL3Q99963 347 aa15.75■□□□□ 0.11
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