RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	GATS	Q8NAP1	163 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	ABHD3	Q8WU67	409 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL15	Q96M94	604 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF145	Q96MT1	663 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	HHATL	Q9HCP6	504 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	MCM8	Q9UJA3	840 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	PCTP	Q9UKL6	214 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	TMCO1	Q9UM00	188 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0J9YW62	118 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC188	H7C350	402 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAMDEC1	O15204	470 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	LYZL6	O75951	148 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	RBP1	P09455	135 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	HPGD	P15428	266 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPAN8	P19075	237 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	IGFBP5	P24593	272 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	GABRA3	P34903	492 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	PAFAH1B1	P43034	410 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINB8	P50452	374 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	MVK	Q03426	396 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	GGTLC2	Q14390	218 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	CPTP	Q5TA50	214 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	RADIL	Q96JH8	1075 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	ADGRG7	Q96K78	797 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		9.58	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A096LNT2	108 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PRB8	838 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	SHISA9	B4DS77	424 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	STX16	O14662	325 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKD3	O94806	890 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT6A	P02538	564 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT6B	P04259	564 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	CSF3	P09919	207 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	CTAGE8	P0CG41	777 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	NTS	P30990	170 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	TTK	P33981	857 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT6C	P48668	564 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	FABP6	P51161	128 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	CDH13	P55290	713 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR5	P85299	388 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	BTK	Q06187	659 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	KIR3DS1	Q14943	382 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	CARTPT	Q16568	116 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	FCRLA	Q7L513	359 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	MUC15	Q8N387	334 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR151	Q8TDV0	419 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF128	Q8TEB7	428 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	PROX1	Q92786	737 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	C3orf49	Q96BT1	292 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	EBPL	Q9BY08	206 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	EQTN	Q9NQ60	294 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	MED17	Q9NVC6	651 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF14	Q9UBS8	474 aa		9.57	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A087WV62	115 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	ESYT3	A0FGR9	886 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	GJE1	A6NN92	205 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	ZSCAN12	O43309	604 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	TCF21	O43680	179 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4F21	O95013	312 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	NUDT14	O95848	222 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	YES1	P07947	543 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	HSD3B1	P14060	373 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	GGT1	P19440	569 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	HSD3B2	P26439	372 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	HMOX2	P30519	316 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	CHRNB3	Q05901	458 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC18A2	Q05940	514 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	C2orf80	Q0P641	193 aa		9.56	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	SPIN4	Q56A73	249 aa		9.56	□□□□□ -0.88

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