RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, human

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNMT1-208	ENST00000586667	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	NIN	Q8N4C6	2090 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SYT5	O00445	386 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	NDUFB5	O43674	189 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	PEX1	O43933	1283 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	DPM1	O60762	260 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SEMA7A	O75326	666 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SNX4	O95219	450 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	WISP1	O95388	367 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667		P04436	131 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	PRG2	P13727	222 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	TNFRSF1B	P20333	461 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	CNR1	P21554	472 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	MEOX1	P50221	254 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF136	P52737	540 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	KCNJ10	P78508	379 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	LY6D	Q14210	128 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	NRF1	Q16656	503 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	CBLL1	Q75N03	491 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	MISP	Q8IVT2	679 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	OR2M3	Q8NG83	312 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	FAM162A	Q96A26	154 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF597	Q96LX8	424 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	RNF145	Q96MT1	663 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	TAAR6	Q96RI8	345 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	PINK1	Q9BXM7	581 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	MFRP	Q9BY79	579 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	IFT52	Q9Y366	437 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667		M0R3H8	397 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	AP3D1	O14617	1153 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	GSTA4	O15217	222 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF264	O43296	627 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	TPST2	O60704	377 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SERPINB7	O75635	380 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	LGI1	O95970	557 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	CSTA	P01040	98 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	FES	P07332	822 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	IL7R	P16871	459 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	HTR2A	P28223	471 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	RFC3	P40938	356 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	CCNI	Q14094	377 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	EID3	Q8N140	333 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	WBP1	Q96G27	269 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	LUZP4	Q9P127	313 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667		H3BNH8	94 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DNMT1-208	ENST00000586667	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
DNMT1-208	ENST00000586667	GNB5	O14775	395 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DNMT1-208	ENST00000586667	HCRTR2	O43614	444 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DNMT1-208	ENST00000586667	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
DNMT1-208	ENST00000586667	PRKD3	O94806	890 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF682	O95780	498 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DNMT1-208	ENST00000586667	CELA3A	P09093	270 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DNMT1-208	ENST00000586667	HPGD	P15428	266 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DNMT1-208	ENST00000586667	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
DNMT1-208	ENST00000586667	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
DNMT1-208	ENST00000586667	SELENOW	P63302	87 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DNMT1-208	ENST00000586667	HOXC5	Q00444	222 aa		11.45	□□□□□ -0.58

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