RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TP53BP2Q13625 1128 aa23.44■■□□□ 1.34
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FNDC5Q8NAU1 212 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF527Q8NB42 609 aa23.44■■□□□ 1.34
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSMA8Q8TAA3 256 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAMTS15Q8TE58 950 aa23.44■■□□□ 1.34
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HS3ST6Q96QI5 342 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CXorf36Q9H7Y0 433 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT16P08779 473 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINGO3P0C6S8 592 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARRB2P32121 409 aa23.43■■□□□ 1.34
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF117Q03924 483 aa23.43■■□□□ 1.34
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL23RQ5VWK5 629 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LILRA2Q8N149 483 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHL15Q96M94 604 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOXD1Q9GZZ0 328 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FANCFQ9NPI8 374 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOX30O94993 753 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C6orf47O95873 294 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP3CBP16298 524 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CARD18P57730 90 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VSNL1P62760 191 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCST2Q5T1A1 773 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OSTF1Q92882 214 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COQ8BQ96D53 544 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCL19Q99731 98 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAV3Q8IVL0 2385 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPIPA7E9PJI5 369 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H3BNH8 94 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUDT14O95848 222 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INHBBP09529 407 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPIPA8P0DM63 369 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRPS1L1P21108 318 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LOXP28300 417 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXF1Q12946 379 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHL26Q53HC5 615 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q5PR19 223 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STAC2Q6ZMT1 411 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C20orf204Q6ZNR8 217 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STK32CQ86UX6 486 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SFXN5Q8TD22 340 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUDT8Q8WV74 236 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MOAP1Q96BY2 351 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TUBGCP3Q96CW5 907 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMR3AQ99954 134 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPATCH2Q9NW75 528 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CFLARO15519 480 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THBDP07204 575 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TUBBP07437 444 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BPGMP07738 259 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ELK4P28324 431 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 P2RX1P51575 399 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CBLN3Q6UW01 205 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BEND4Q6ZU67 534 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TIGARQ9NQ88 270 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CARD8Q9Y2G2 431 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNE3Q9Y6H6 103 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OIP5O43482 229 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CREB1P16220 341 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADH6P28332 368 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SHC1P29353 583 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AGTR1P30556 359 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP12AP54707 1039 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BEX5Q5H9J7 111 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIMKLAQ8IXN7 391 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXO27Q8NI29 283 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ROBO4Q8WZ75 1007 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DUSP26Q9BV47 211 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C12orf49Q9H741 205 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ICAM5Q9UMF0 924 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACTL7BQ9Y614 415 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
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