RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 RPL3P39023 403 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 CPA2P48052 419 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 ZNF117Q03924 483 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 FAM27E3Q08E93 113 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 GANABQ14697 944 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 TESK1Q15569 626 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 BCL2A1Q16548 175 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 TMEM44Q2T9K0 475 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 CBLN3Q6UW01 205 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 CHMP1BQ7LBR1 199 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 BTLAQ7Z6A9 289 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 HMGN2P46Q86SG4 172 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 MEIOBQ8N635 442 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 ZNF614Q8N883 585 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 OR56A1Q8NGH5 318 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 RFWD2Q8NHY2 731 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 PSMA8Q8TAA3 256 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 ADAMTS15Q8TE58 950 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 STARD4Q96DR4 205 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 PGM2Q96G03 612 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 TEX37Q96LM6 180 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 RNF145Q96MT1 663 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 STACQ99469 402 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 PIGQQ9BRB3 760 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 SFXN3Q9BWM7 321 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 UBQLN4Q9NRR5 601 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 RASSF1Q9NS23 344 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 MED17Q9NVC6 651 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 ATAD3AQ9NVI7 634 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 CLEC4AQ9UMR7 237 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 CCDC168Q8NDH2 2452 aa9.55□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 SPG11Q96JI7 2443 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 A0A0J9YW62 118 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 A0A1W2PPR1 153 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 TMEM120BA0PK00 339 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 FAM221AA4D161 298 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 GOLGA8OA6NCC3 632 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 A8MXE2 369 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 GOLGA8NF8WBI6 632 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 SCDO00767 359 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 SDHDO14521 159 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 ANKRD28O15084 1053 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 EFNA2O43921 213 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 SCN2BO60939 215 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 TNFRSF21O75509 655 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 NGFRP08138 427 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 HPGDP15428 266 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 MATN1P21941 496 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 IL12AP29459 219 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 CPOXP36551 454 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 IST1P53990 364 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 PRSS12P56730 875 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 FOXF1Q12946 379 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 PLPPR5Q32ZL2 321 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 SPANXN4Q5MJ08 99 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 HHATQ5VTY9 493 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 C6orf120Q7Z4R8 191 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 CAMKMTQ7Z624 323 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 OR4A15Q8NGL6 344 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 SFXN5Q8TD22 340 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 RAB8BQ92930 207 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 DTNBP1Q96EV8 351 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 MARK4Q96L34 752 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 DPY30Q9C005 99 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 DUSP22Q9NRW4 184 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 ASIC5Q9NY37 505 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 KCNE5Q9UJ90 142 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 HAO1Q9UJM8 370 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 PACSIN3Q9UKS6 424 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 CARD8Q9Y2G2 431 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 ACTL7BQ9Y614 415 aa9.54□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 NPIPB9F8W1W9 429 aa9.53□□□□□ -0.88
NELFE-213ENST00000494956 TNFSF11O14788 317 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.1 ms