RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373779.7

PTPRU-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-202ENST00000373779 TPRA1Q86W33 373 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 FOXRED2Q8IWF2 684 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 BEST3Q8N1M1 668 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 IFNA21P01568 189 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 NPPBP16860 134 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 CHRNEQ04844 493 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 FAHD1Q6P587 224 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 C12orf40Q86WS4 652 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 POGLUT1Q8NBL1 392 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 OR2T4Q8NH00 348 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 CREB3L4Q8TEY5 395 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 HCKP08631 526 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 CEBPGP53567 150 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 RAB11BQ15907 218 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 EOGTQ5NDL2 527 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 PPP2R2DQ66LE6 453 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 CYHR1Q6ZMK1 362 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 PLA2G15Q8NCC3 412 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 TM4SF18Q96CE8 201 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 TMEM41AQ96HV5 264 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 MS4A8Q9BY19 250 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 MT-ND4P03905 459 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 AGTR1P30556 359 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 PDE7AQ13946 482 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF765Q7L2R6 523 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 FAM109AQ8N4B1 249 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 OR2M2Q96R28 347 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 CDCA4Q9BXL8 241 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 BOLA1Q9Y3E2 137 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 FGL1Q08830 312 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 EFR3AQ14156 821 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 GDPD3Q7L5L3 318 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 NANOGP1Q8N7R0 232 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 DOK1Q99704 481 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 IL21RQ9HBE5 538 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SLC39A1Q9NY26 324 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF225Q9UK10 706 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 F5H0A9 414 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 PHYHO14832 338 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 APOC3P02656 99 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SLC6A9P48067 706 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 STOML3Q8TAV4 291 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 RHNO1Q9BSD3 238 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SDHAF3Q9NRP4 125 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 H7C2Y5 167 aa16.33■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 AIFM1O95831 613 aa16.33■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 RUNX3Q13761 415 aa16.33■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 OCLNQ16625 522 aa16.33■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 CCDC58Q4VC31 144 aa16.33■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 PTCHD1Q96NR3 888 aa16.33■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SLC25A18Q9H1K4 315 aa16.33■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 GYPBP06028 91 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 POU4F3Q15319 338 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 DUSP7Q16829 419 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 FAM205BPQ63HN1 556 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 TMEM205Q6UW68 189 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 PTOV1Q86YD1 416 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 TRAV27A0A087WT01 109 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 GOSR2O14653 212 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 ABLIM3O94929 683 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 PCGF3Q3KNV8 242 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 ARHGAP40Q5TG30 622 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 HBMQ6B0K9 141 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 OR5M3Q8NGP4 307 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 DNAJA3Q96EY1 480 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 ABRACLQ9P1F3 81 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 TMEM202A6NGA9 273 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 ALDOBP05062 364 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 PTH2RP49190 550 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 CTXN1P60606 82 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 GAREM2Q75VX8 874 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 MSLNLQ96KJ4 702 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 TEX46H3BTG2 121 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 FXYD6P3P58550 94 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 ACTBP60709 375 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 ACTG1P63261 375 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 CCNJQ5T5M9 372 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 MTFR2Q6P444 385 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 ZIC5Q96T25 663 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 MRI1Q9BV20 369 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 CLEC4EQ9ULY5 219 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 GPR89AB7ZAQ6 455 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 GPX5O75715 221 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 GPR89BP0CG08 455 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRU-202ENST00000373779 PRPS1P60891 318 aa16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.8 ms