RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	OR4C3	Q8NH37	302 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXO30	Q8TB52	745 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	EGLN2	Q96KS0	407 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF145	Q96MT1	663 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	FMO2	Q99518	471 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	C12orf49	Q9H741	205 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A0J9YW62	118 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1W2PRB8	838 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	SERTM1	A2A2V5	107 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	ALG1L2	C9J202	215 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	GOLGA8R	I6L899	631 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	ADAMDEC1	O15204	470 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	NTN1	O95631	604 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	SOD3	P08294	240 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	ACP2	P11117	423 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	SHC1	P29353	583 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	DMTN	Q08495	405 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	HSPB3	Q12988	150 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	VEZF1	Q14119	521 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	TSC22D1	Q15714	1073 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	CEP112	Q8N8E3	955 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	POC1B	Q8TC44	478 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	NEUROG1	Q92886	237 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	S100PBP	Q96BU1	408 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	GIMAP5	Q96F15	307 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	MED17	Q9NVC6	651 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	EMCN	Q9ULC0	261 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	NFU1	Q9UMS0	254 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	C7orf72	A4D263	438 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	OVOL3	O00110	214 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	TMCC2	O75069	709 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	NKX2-2	O95096	273 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNH1	O95259	989 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	DANCR	P0C864	163 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	CDKN1A	P38936	164 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC18A2	Q05940	514 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC29A2	Q14542	456 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	CD226	Q15762	336 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF385B	Q569K4	471 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	BEND4	Q6ZU67	534 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR151	Q8TDV0	419 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	ABHD3	Q8WU67	409 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	IFT81	Q8WYA0	676 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	PLCE1	Q9P212	2302 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A087WZY1	265 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338		G3V2L1	256 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	CLOCK	O15516	846 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	NDUFB5	O43674	189 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	NDUFS7	O75251	213 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	SYNGR4	O95473	234 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	TUBB	P07437	444 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	NGFR	P08138	427 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	IFI6	P09912	130 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-233	ENST00000602338	PRIM2	P49643	509 aa		10.63	□□□□□ -0.71

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