RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429762.7

VSX1-205, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VSX1, Length 1,977 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1-205ENST00000429762 FAM198BQ6UWH4 519 aa20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 GDF7Q7Z4P5 450 aa20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 NKAIN4Q8IVV8 208 aa20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 PSD2Q9BQI7 771 aa20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 GABARAPL3Q9BY60 117 aa20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 ING2Q9H160 280 aa20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 TOR4AQ9NXH8 423 aa20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 MYRFQ9Y2G1 1151 aa20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 CFAP54Q96N23 3096 aa20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 FRG2CA6NGY1 282 aa20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 ADAM11O75078 769 aa20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 UGT2B11O75310 529 aa20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 ATP6V1B1P15313 513 aa20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 GPR143P51810 404 aa20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 RPP38P78345 283 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 CD47Q08722 323 aa20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 DECR1Q16698 335 aa20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 DHRS13Q6UX07 377 aa20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 THAP5Q7Z6K1 395 aa20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 MORN4Q8NDC4 146 aa20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 OR4K5Q8NGD3 323 aa20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 SLC41A3Q96GZ6 507 aa20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 CFL2Q9Y281 166 aa20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa20.37■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 B4E171 279 aa20.36■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 CSO75390 466 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 DRD5P21918 477 aa20.36■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 TSPAN7P41732 249 aa20.36■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 ATP12AP54707 1039 aa20.36■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 IL5RAQ01344 420 aa20.36■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 ZNF141Q15928 474 aa20.36■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 CSRP2Q16527 193 aa20.36■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 ISXQ2M1V0 245 aa20.36■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 RAB11FIP2Q7L804 512 aa20.36■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 SLC29A4Q7RTT9 530 aa20.36■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 UBE2FQ969M7 185 aa20.36■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 SLC26A1Q9H2B4 701 aa20.36■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 SLC7A7Q9UM01 511 aa20.36■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 ARRDC5A6NEK1 342 aa20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 SAGE2PA6NJ88 616 aa20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 TTC36A6NLP5 189 aa20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 SOX14O95416 240 aa20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 TRAM2Q15035 370 aa20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 CNIH3Q8TBE1 160 aa20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 RNF217Q8TC41 542 aa20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 FKBP10Q96AY3 582 aa20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 ADOQ96SZ5 270 aa20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 STRADBQ9C0K7 418 aa20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 A0A087WUU8 490 aa20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 DPPA5A6NC42 116 aa20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 PIP5K1CO60331 668 aa20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 IL33O95760 270 aa20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 UGT2B15P54855 530 aa20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 FGFBP1Q14512 234 aa20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 OR1Q1Q15612 314 aa20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 AP1ARQ63HQ0 302 aa20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 TMEM255BQ8WV15 326 aa20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 PMM1Q92871 262 aa20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 CDC6Q99741 560 aa20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 GPA33Q99795 319 aa20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa20.34■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 REM1O75628 298 aa20.34■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 UTS2O95399 124 aa20.34■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 GUSBP08236 651 aa20.34■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 MMP11P24347 488 aa20.34■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 POU1F1P28069 291 aa20.34■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 ISL1P61371 349 aa20.34■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 ST3GAL3Q11203 375 aa20.34■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 DCAF12Q5T6F0 453 aa20.34■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 CDCP2Q5VXM1 449 aa20.34■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 TMEM236Q5W0B7 351 aa20.34■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 LAIR2Q6ISS4 152 aa20.34■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa20.34■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 ZER1Q7Z7L7 766 aa20.34■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 SLCO6A1Q86UG4 719 aa20.34■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 APCDD1LQ8NCL9 501 aa20.34■□□□□ 0.85
VSX1-205ENST00000429762 C7orf57Q8NEG2 295 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms