RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272638.13

UBXN4-201, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN4, Length 4,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-201ENST00000272638 UBE2UQ5VVX9 321 aa11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 LYSMD2Q8IV50 215 aa11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 ELOA3Q8NG57 546 aa11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 OR52R1Q8NGF1 315 aa11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 SLC35A4Q96G79 324 aa11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 LRRN3Q9H3W5 708 aa11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 CA14Q9ULX7 337 aa11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 SSNA1O43805 119 aa11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 SLC25A12O75746 678 aa11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 UBXN7O94888 489 aa11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 PKLRP30613 574 aa11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 CTHP32929 405 aa11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 PSMB10P40306 273 aa11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 MVDP53602 400 aa11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 IFITM3Q01628 133 aa11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 DUSP2Q05923 314 aa11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 E2F2Q14209 437 aa11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 TTLL10Q6ZVT0 673 aa11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 COMMD2Q86X83 199 aa11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 PFN4Q8NHR9 129 aa11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 TBC1D20Q96BZ9 403 aa11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 MS4A4EQ96PG1 132 aa11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 PINK1Q9BXM7 581 aa11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 A4GALTQ9NPC4 353 aa11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 UCKL1Q9NWZ5 548 aa11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 PTPRDP23468 1912 aa11.73□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 ASXL3Q9C0F0 2248 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 RCBTB2O95199 551 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF3P17036 446 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 EDNRAP25101 427 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 CD6P30203 668 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 CD97P48960 835 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 NEDD4LQ96PU5 975 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 DPYSL5Q9BPU6 564 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 TIMM29Q9BSF4 260 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 NDC1Q9BTX1 674 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 NEK6Q9HC98 313 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 GXYLT2A0PJZ3 443 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 SPINT1O43278 529 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 KLHL18O94889 574 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 HCCSP53701 268 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 DCST2Q5T1A1 773 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF544Q6NX49 715 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 SYT9Q86SS6 491 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 JAZF1Q86VZ6 243 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM239Q8WW34 195 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 FAM3CQ92520 227 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 RSC1A1Q92681 617 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 RIT1Q92963 219 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 GAL3ST3Q96A11 431 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 DOK1Q99704 481 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 SLC22A4Q9H015 551 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 Q9N2J8 555 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 STMN3Q9NZ72 180 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 PLGP00747 810 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 SPNP16150 400 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 PPP1CAP62136 330 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF181Q2M3W8 571 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 DEFB133Q30KQ1 61 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 CNIH2Q6PI25 160 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 LUZP2Q86TE4 346 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 PITX2Q99697 317 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 MROQ9BYG7 248 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 DZANK1Q9NVP4 752 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 FBXO34Q9NWN3 711 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 ERVK-19Q9WJR5 959 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 IRGMA1A4Y4 181 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 HRO43593 1189 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 ADAM23O75077 832 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 TFPIP10646 304 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 GRK6P43250 576 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 SLX4IPQ5VYV7 408 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 RPTNQ6XPR3 784 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 SLC44A3Q8N4M1 653 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 VWCEQ96DN2 955 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 HSPA12BQ96MM6 686 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 CHIAQ9BZP6 476 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 CD207Q9UJ71 328 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 POLR1DQ9Y2S0 133 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 TRAPPC13A5PLN9 417 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 NDUFB5O43674 189 aa11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms