RNA–Protein interactions for RNA: Q0055

AI2, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI2	Q0055	RSC58	Q07979	502 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	GPR1	Q12361	961 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	DPH6	Q12429	685 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	INO1	P11986	533 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	RAD16	P31244	790 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	GEX2	P36173	615 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	DYS1	P38791	387 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	PNT1	P38969	423 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	ENV11	P53246	860 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	TIM10	P87108	93 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	UBP2	Q01476	1272 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	VPS30	Q02948	557 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	SCM3	Q12334	223 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	OSH2	Q12451	1283 aa		3.21	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	MRP10	O75012	95 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	MTF2	P10849	440 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	HMG1	P12683	1054 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	MSM1	P22438	575 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	AXL2	P38928	823 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	SIP4	P46954	829 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	UBP15	P50101	1230 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	ARP4	P80428	489 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	HFD1	Q04458	532 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	TDA9	Q04545	1251 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	DCS2	Q12123	353 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	YOL114C	Q12322	202 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	AAC3	P18238	307 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	RPC53	P25441	422 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	SWI3	P32591	825 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	YPT7	P32939	208 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	STE13	P33894	931 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	BLI1	P35727	113 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	YBR284W	P38150	797 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	MSC7	P38694	644 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	YGL176C	P46945	554 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	TRE2	Q08693	809 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	RKM4	Q12504	494 aa		3.2	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	AEP2	P22136	580 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	DPH2	P32461	534 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	KAP122	P32767	1081 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	MDJ1	P35191	511 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	ESL2	P36168	1195 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	NPR2	P39923	615 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	MAM1	P40065	302 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	HUL4	P40985	892 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	IRC5	P43610	853 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	AIM14	P53109	570 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	YNR065C	P53751	1116 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	GTR1	Q00582	310 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	SGD1	Q06132	899 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	NYV1	Q12255	253 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.19	□□□□□ -1.9	not detected
AI2	Q0055	OSH7	P38755	437 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	LAM1	P38851	1228 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	RSC3	Q06639	885 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	ENV7	Q12003	364 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	DIN7	Q12086	430 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.18	□□□□□ -1.9	not detected
AI2	Q0055	YER152C	P10356	443 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	RED1	P14291	827 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	PAH1	P32567	862 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	OAF3	P36023	863 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	MAD2	P40958	196 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	TAF1	P46677	1066 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	GPI8	P49018	411 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	NSE5	Q03718	556 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	OPY2	Q06810	360 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	AAD3	P25612	363 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	UGA2	P38067	497 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AI2	Q0055	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9

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