RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608842.1

DGCR6-208, Transcript of DiGeorge syndrome critical region gene 6, human

TSL 2 BASIC

Gene DGCR6, Length 1,837 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DGCR6-208	ENST00000608842	CDC45	O75419	566 aa		28.8	■■■□□ 2.2
DGCR6-208	ENST00000608842	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
DGCR6-208	ENST00000608842	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		28.8	■■■□□ 2.2
DGCR6-208	ENST00000608842	AOX1	Q06278	1338 aa		28.79	■■■□□ 2.2
DGCR6-208	ENST00000608842	SASH1	O94885	1247 aa		28.78	■■■□□ 2.2
DGCR6-208	ENST00000608842	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
DGCR6-208	ENST00000608842	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		28.78	■■■□□ 2.2
DGCR6-208	ENST00000608842	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		28.78	■■■□□ 2.2
DGCR6-208	ENST00000608842	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
DGCR6-208	ENST00000608842	COPRS	Q9NQ92	184 aa		28.78	■■■□□ 2.2
DGCR6-208	ENST00000608842	LY75	O60449	1722 aa		28.78	■■■□□ 2.2
DGCR6-208	ENST00000608842	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		28.78	■■■□□ 2.2
DGCR6-208	ENST00000608842	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
DGCR6-208	ENST00000608842	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		28.77	■■■□□ 2.2
DGCR6-208	ENST00000608842	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
DGCR6-208	ENST00000608842	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		28.77	■■■□□ 2.2
DGCR6-208	ENST00000608842	MYH3	P11055	1940 aa		28.76	■■■□□ 2.2
DGCR6-208	ENST00000608842	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
DGCR6-208	ENST00000608842	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		28.76	■■■□□ 2.19
DGCR6-208	ENST00000608842	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
DGCR6-208	ENST00000608842	FAM182B	Q5T319	152 aa		28.76	■■■□□ 2.19
DGCR6-208	ENST00000608842	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
DGCR6-208	ENST00000608842	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		28.75	■■■□□ 2.19
DGCR6-208	ENST00000608842	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		28.75	■■■□□ 2.19
DGCR6-208	ENST00000608842	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
DGCR6-208	ENST00000608842	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		28.74	■■■□□ 2.19
DGCR6-208	ENST00000608842	ARX	Q96QS3	562 aa		28.74	■■■□□ 2.19
DGCR6-208	ENST00000608842	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	28.73	■■■□□ 2.19
DGCR6-208	ENST00000608842	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		28.73	■■■□□ 2.19
DGCR6-208	ENST00000608842	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		28.73	■■■□□ 2.19
DGCR6-208	ENST00000608842	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		28.73	■■■□□ 2.19
DGCR6-208	ENST00000608842	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
DGCR6-208	ENST00000608842	NLRP10	Q86W26	655 aa		28.73	■■■□□ 2.19
DGCR6-208	ENST00000608842	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		28.72	■■■□□ 2.19
DGCR6-208	ENST00000608842	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
DGCR6-208	ENST00000608842	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		28.72	■■■□□ 2.19
DGCR6-208	ENST00000608842	SIL1	Q9H173	461 aa		28.72	■■■□□ 2.19
DGCR6-208	ENST00000608842	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
DGCR6-208	ENST00000608842	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
DGCR6-208	ENST00000608842	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		28.71	■■■□□ 2.19
DGCR6-208	ENST00000608842	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		28.7	■■■□□ 2.18
DGCR6-208	ENST00000608842	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		28.7	■■■□□ 2.18
DGCR6-208	ENST00000608842	GPT	P24298	496 aa		28.69	■■■□□ 2.18
DGCR6-208	ENST00000608842	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
DGCR6-208	ENST00000608842	FAM89A	Q96GI7	184 aa		28.69	■■■□□ 2.18
DGCR6-208	ENST00000608842	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		28.69	■■■□□ 2.18
DGCR6-208	ENST00000608842	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		28.69	■■■□□ 2.18
DGCR6-208	ENST00000608842	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		28.68	■■■□□ 2.18
DGCR6-208	ENST00000608842	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
DGCR6-208	ENST00000608842	CAMTA2	O94983	1202 aa		28.66	■■■□□ 2.18
DGCR6-208	ENST00000608842	KCNQ4	P56696	695 aa		28.66	■■■□□ 2.18
DGCR6-208	ENST00000608842	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		28.65	■■■□□ 2.18
DGCR6-208	ENST00000608842	AACS	Q86V21	672 aa		28.65	■■■□□ 2.18
DGCR6-208	ENST00000608842	SYNE4	Q8N205	404 aa		28.65	■■■□□ 2.18
DGCR6-208	ENST00000608842	SCN7A	Q01118	1682 aa		28.64	■■■□□ 2.17
DGCR6-208	ENST00000608842	CSF1R	P07333	972 aa		28.64	■■■□□ 2.17
DGCR6-208	ENST00000608842	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		28.64	■■■□□ 2.17
DGCR6-208	ENST00000608842	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
DGCR6-208	ENST00000608842	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
DGCR6-208	ENST00000608842	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		28.63	■■■□□ 2.17
DGCR6-208	ENST00000608842	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		28.63	■■■□□ 2.17
DGCR6-208	ENST00000608842	LAMB2	P55268	1798 aa		28.62	■■■□□ 2.17
DGCR6-208	ENST00000608842	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		28.61	■■■□□ 2.17
DGCR6-208	ENST00000608842	TFCP2	Q12800	502 aa		28.61	■■■□□ 2.17
DGCR6-208	ENST00000608842	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
DGCR6-208	ENST00000608842	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
DGCR6-208	ENST00000608842	CASC1	Q6TDU7	716 aa		28.6	■■■□□ 2.17
DGCR6-208	ENST00000608842	RILPL2	Q969X0	211 aa		28.6	■■■□□ 2.17
DGCR6-208	ENST00000608842	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
DGCR6-208	ENST00000608842	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
DGCR6-208	ENST00000608842	CHML	P26374	656 aa		28.59	■■■□□ 2.17
DGCR6-208	ENST00000608842	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
DGCR6-208	ENST00000608842	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
DGCR6-208	ENST00000608842	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
DGCR6-208	ENST00000608842	TNNI3K	Q59H18	835 aa		28.58	■■■□□ 2.17
DGCR6-208	ENST00000608842	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		28.58	■■■□□ 2.17
DGCR6-208	ENST00000608842	CASZ1	Q86V15	1759 aa		28.58	■■■□□ 2.17
DGCR6-208	ENST00000608842	C4B	P0C0L5	1744 aa		28.58	■■■□□ 2.17
DGCR6-208	ENST00000608842	ERC2	O15083	957 aa		28.57	■■■□□ 2.16
DGCR6-208	ENST00000608842	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
DGCR6-208	ENST00000608842	SUSD4	Q5VX71	490 aa		28.57	■■■□□ 2.16
DGCR6-208	ENST00000608842	KIF2C	Q99661	725 aa		28.57	■■■□□ 2.16
DGCR6-208	ENST00000608842	EYA2	O00167	538 aa		28.57	■■■□□ 2.16
DGCR6-208	ENST00000608842	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		28.57	■■■□□ 2.16
DGCR6-208	ENST00000608842	GPATCH3	Q96I76	525 aa		28.57	■■■□□ 2.16
DGCR6-208	ENST00000608842	USP26	Q9BXU7	913 aa		28.57	■■■□□ 2.16
DGCR6-208	ENST00000608842	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
DGCR6-208	ENST00000608842	CIAO1	O76071	339 aa		28.56	■■■□□ 2.16
DGCR6-208	ENST00000608842	SLC4A3	P48751	1232 aa		28.56	■■■□□ 2.16
DGCR6-208	ENST00000608842	LRRC24	Q50LG9	513 aa		28.56	■■■□□ 2.16
DGCR6-208	ENST00000608842	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
DGCR6-208	ENST00000608842	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
DGCR6-208	ENST00000608842	C4A	P0C0L4	1744 aa		28.55	■■■□□ 2.16
DGCR6-208	ENST00000608842	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
DGCR6-208	ENST00000608842	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		28.55	■■■□□ 2.16
DGCR6-208	ENST00000608842	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		28.55	■■■□□ 2.16
DGCR6-208	ENST00000608842	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
DGCR6-208	ENST00000608842	CTSW	P56202	376 aa		28.54	■■■□□ 2.16
DGCR6-208	ENST00000608842	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	28.54	■■■□□ 2.16
DGCR6-208	ENST00000608842	PARP10	Q53GL7	1025 aa		28.53	■■■□□ 2.16

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