RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596148.2

TRAPPC5-204, Transcript of trafficking protein particle complex 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC5, Length 5,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC5-204ENST00000596148 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 ATP8B2P98198 1209 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 NLRP3Q96P20 1036 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 COPS6Q7L5N1 327 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 VPS36Q86VN1 386 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 USP16Q9Y5T5 823 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 MCM5P33992 734 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 DCAF5Q96JK2 942 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 ATP2B3Q16720 1220 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 ATP10AO60312 1499 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 KANK3Q6NY19 840 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 CALML4Q96GE6 196 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 ZSCAN12O43309 604 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 SPA17Q15506 151 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 CCDC148Q8NFR7 591 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 LINS1Q8NG48 757 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 SYCE3A1L190 88 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 BMP15O95972 392 aa23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 FEZ1Q99689 392 aa23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC5-204ENST00000596148 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 ANAPC15P60006 121 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 CNNM3Q8NE01 707 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 GJB2P29033 226 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 SNRKQ9NRH2 765 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 TTC41PQ6P2S7 1318 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 STX6O43752 255 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 CAMK4Q16566 473 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 CCDC150Q8NCX0 1101 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 IP6K1Q92551 441 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 ATP7AQ04656 1500 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 CAVIN2O95810 425 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 GNAQP50148 359 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 SCLT1Q96NL6 688 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 MEIS3Q99687 375 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 CCT2P78371 535 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 ADGRL2O95490 1459 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 ESR2Q92731 530 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 GNAT2P19087 354 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 NEFHP12036 1026 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 WTAPQ15007 396 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 LEKR1Q6ZMV7 388 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 FSIP1Q8NA03 581 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 FAM114A1Q8IWE2 563 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 PBRM1Q86U86 1689 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 A0A1W2PP64 1363 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 GCP02774 474 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 NEMFO60524 1076 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 GUCY1B3Q02153 619 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 CETN1Q12798 172 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 PDE1AP54750 535 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 ANXA1P04083 346 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 CYP7A1P22680 504 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 TOP1P11387 765 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 CCDC82Q8N4S0 544 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 GBP3Q9H0R5 595 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 HOXC9P31274 260 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 TESK2Q96S53 571 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC5-204ENST00000596148 NEBLO76041 1014 aa23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC5-204ENST00000596148 STX1AQ16623 288 aa23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC5-204ENST00000596148 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC5-204ENST00000596148 SLC39A6Q13433 755 aa23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC5-204ENST00000596148 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC5-204ENST00000596148 PLCG2P16885 1265 aa23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC5-204ENST00000596148 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms