RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	MSH5	O43196	834 aa		11.51	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		11.51	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		11.51	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		11.51	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		11.51	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		11.51	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	RGL2	O15211	777 aa		11.5	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		11.5	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCN7A	Q01118	1682 aa		11.5	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	UTY	O14607	1347 aa		11.5	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	GNAI2	P04899	355 aa		11.5	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	GYS1	P13807	737 aa		11.5	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		11.5	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		11.5	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM177B	A6PVY3	158 aa		11.5	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576		H7C1W4	665 aa		11.49	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	SUSD4	Q5VX71	490 aa		11.49	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM89A	Q96GI7	184 aa		11.49	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		11.49	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		11.49	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	CASP7	P55210	303 aa		11.48	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	PARP10	Q53GL7	1025 aa		11.48	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	SYNE4	Q8N205	404 aa		11.48	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	SETDB2	Q96T68	719 aa		11.48	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	KAZALD1	Q96I82	304 aa		11.48	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	SUCLG2	Q96I99	432 aa		11.48	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	NFIX	Q14938	502 aa		11.48	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		11.47	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	CEP85	Q6P2H3	762 aa		11.47	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	NTSR2	O95665	410 aa		11.47	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		11.47	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		11.47	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		11.46	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		11.46	□□□□□ -0.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		11.46	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHD	P01880	384 aa		11.46	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		11.46	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	MSL1	Q68DK7	614 aa		11.45	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		11.45	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		11.45	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	TM4SF1	P30408	202 aa		11.45	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		11.45	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		11.44	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		11.44	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	SRGAP3	O43295	1099 aa		11.44	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	FOXO4	P98177	505 aa		11.44	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP8B2	P98198	1209 aa		11.44	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	DDR1	Q08345	913 aa		11.44	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERFE	Q4G0M1	354 aa		11.44	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		11.44	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		11.44	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	NYX	Q9GZU5	481 aa		11.44	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		11.43	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	MTX1	Q13505	466 aa		11.43	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		11.43	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		11.43	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	NPHP1	O15259	732 aa		11.43	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	MMP10	P09238	476 aa		11.43	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		11.43	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	SERPINB2	P05120	415 aa		11.42	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	CNBD1	Q8NA66	436 aa		11.42	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		11.42	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	HMMR	O75330	724 aa		11.42	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		11.42	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	ABCC12	Q96J65	1359 aa		11.42	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDE8A	O60658	829 aa		11.42	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	SSH3	Q8TE77	659 aa		11.42	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	CTSW	P56202	376 aa		11.41	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		11.41	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	POLA2	Q14181	598 aa		11.41	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		11.41	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	CSF1R	P07333	972 aa		11.41	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		11.41	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		11.41	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM161A	Q3B820	660 aa		11.4	□□□□□ -0.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		11.4	□□□□□ -0.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms