RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP27.3■■□□□ 1.96
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
PPP4C-211ENST00000567642 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
PPP4C-211ENST00000567642 RIC1Q4ADV7 1423 aa27.29■■□□□ 1.96
PPP4C-211ENST00000567642 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
PPP4C-211ENST00000567642 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa27.28■■□□□ 1.96
PPP4C-211ENST00000567642 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa27.28■■□□□ 1.96
PPP4C-211ENST00000567642 CFAP44Q96MT7 982 aa27.28■■□□□ 1.96
PPP4C-211ENST00000567642 CHPF2Q9P2E5 772 aa27.28■■□□□ 1.96
PPP4C-211ENST00000567642 POTECB2RU33 542 aa27.27■■□□□ 1.96
PPP4C-211ENST00000567642 DDNO94850 711 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
PPP4C-211ENST00000567642 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
PPP4C-211ENST00000567642 SYNE4Q8N205 404 aa27.26■■□□□ 1.95
PPP4C-211ENST00000567642 NLRP3Q96P20 1036 aa27.26■■□□□ 1.95
PPP4C-211ENST00000567642 LAMB2P55268 1798 aa27.26■■□□□ 1.95
PPP4C-211ENST00000567642 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
PPP4C-211ENST00000567642 C3orf67Q6ZVT6 689 aa27.25■■□□□ 1.95
PPP4C-211ENST00000567642 MBIPQ9NS73 344 aa27.25■■□□□ 1.95
PPP4C-211ENST00000567642 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
PPP4C-211ENST00000567642 HOXB7P09629 217 aa27.24■■□□□ 1.95
PPP4C-211ENST00000567642 HTRA3P83110 453 aa27.24■■□□□ 1.95
PPP4C-211ENST00000567642 DUSP27Q5VZP5 1158 aa27.24■■□□□ 1.95
PPP4C-211ENST00000567642 TCIRG1Q13488 830 aa27.23■■□□□ 1.95
PPP4C-211ENST00000567642 CRAMP1Q96RY5 1269 aa27.23■■□□□ 1.95
PPP4C-211ENST00000567642 IARSP41252 1262 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
PPP4C-211ENST00000567642 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
PPP4C-211ENST00000567642 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa27.22■■□□□ 1.95
PPP4C-211ENST00000567642 NLRP10Q86W26 655 aa27.22■■□□□ 1.95
PPP4C-211ENST00000567642 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
PPP4C-211ENST00000567642 SCN4AP35499 1836 aa27.22■■□□□ 1.95
PPP4C-211ENST00000567642 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
PPP4C-211ENST00000567642 SLC10A5Q5PT55 438 aa27.21■■□□□ 1.95
PPP4C-211ENST00000567642 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
PPP4C-211ENST00000567642 GNAI1P63096 354 aa27.2■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa27.2■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF428Q96B54 188 aa27.2■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 PSMD1Q99460 953 aa27.2■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 IFT57Q9NWB7 429 aa27.2■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 RNF123Q5XPI4 1314 aa27.19■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF853P0CG23 659 aa27.19■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC184Q52MB2 194 aa27.19■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa27.19■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 PLBD2Q8NHP8 589 aa27.19■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF541Q9H0D2 1346 aa27.18■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 HYPKQ9NX55 129 aa27.18■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 SNED1Q8TER0 1413 aa27.17■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 TAF1P21675 1872 aa27.17■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 IQCA1LA6NCM1 817 aa27.17■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 JDP2Q8WYK2 163 aa27.17■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 SH3TC1Q8TE82 1336 aa27.16■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 GRIPAP1Q4V328 841 aa27.16■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 SLC51AQ86UW1 340 aa27.16■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 ABCC4O15439 1325 aa27.15■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa27.14■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 FZD9O00144 591 aa27.14■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
PPP4C-211ENST00000567642 POTEIP0CG38 1075 aa27.13■■□□□ 1.93
PPP4C-211ENST00000567642 POTEJP0CG39 1038 aa27.13■■□□□ 1.93
PPP4C-211ENST00000567642 CHADLQ6NUI6 762 aa27.13■■□□□ 1.93
PPP4C-211ENST00000567642 KLRG1Q96E93 195 aa27.13■■□□□ 1.93
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
PPP4C-211ENST00000567642 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
PPP4C-211ENST00000567642 LARGE2Q8N3Y3 721 aa27.12■■□□□ 1.93
PPP4C-211ENST00000567642 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
PPP4C-211ENST00000567642 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa27.12■■□□□ 1.93
PPP4C-211ENST00000567642 EIF6P56537 245 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
PPP4C-211ENST00000567642 RIC3Q7Z5B4 369 aa27.11■■□□□ 1.93
PPP4C-211ENST00000567642 ISCA1Q9BUE6 129 aa27.11■■□□□ 1.93
PPP4C-211ENST00000567642 GOLGA2Q08379 1002 aa27.1■■□□□ 1.93
PPP4C-211ENST00000567642 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
PPP4C-211ENST00000567642 C8orf58Q8NAV2 365 aa27.1■■□□□ 1.93
PPP4C-211ENST00000567642 HACL1Q9UJ83 578 aa27.1■■□□□ 1.93
PPP4C-211ENST00000567642 GJA3Q9Y6H8 435 aa27.1■■□□□ 1.93
PPP4C-211ENST00000567642 COL4A5P29400 1685 aa27.1■■□□□ 1.93
PPP4C-211ENST00000567642 ANP32CO43423 234 aa27.09■■□□□ 1.93
PPP4C-211ENST00000567642 BBOX1O75936 387 aa27.09■■□□□ 1.93
PPP4C-211ENST00000567642 FAM89AQ96GI7 184 aa27.09■■□□□ 1.93
PPP4C-211ENST00000567642 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
PPP4C-211ENST00000567642 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
PPP4C-211ENST00000567642 GPC2Q8N158 579 aa27.08■■□□□ 1.93
PPP4C-211ENST00000567642 MRS2Q9HD23 443 aa27.08■■□□□ 1.93
PPP4C-211ENST00000567642 PPIP5K2O43314 1243 aa27.07■■□□□ 1.92
PPP4C-211ENST00000567642 GRAPQ13588 217 aa27.07■■□□□ 1.92
PPP4C-211ENST00000567642 LDHDQ86WU2 507 aa27.07■■□□□ 1.92
PPP4C-211ENST00000567642 NIM1KQ8IY84 436 aa27.07■■□□□ 1.92
PPP4C-211ENST00000567642 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
PPP4C-211ENST00000567642 CLEC11AQ9Y240 323 aa27.07■■□□□ 1.92
PPP4C-211ENST00000567642 EPHX2P34913 555 aa27.06■■□□□ 1.92
PPP4C-211ENST00000567642 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
PPP4C-211ENST00000567642 SP8Q8IXZ3 490 aa27.06■■□□□ 1.92
PPP4C-211ENST00000567642 SUPT20HQ8NEM7 779 aa27.06■■□□□ 1.92
PPP4C-211ENST00000567642 AOC3Q16853 763 aa27.05■■□□□ 1.92
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC30Q5VVM6 783 aa27.05■■□□□ 1.92
PPP4C-211ENST00000567642 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
PPP4C-211ENST00000567642 CHMP4AQ9BY43 222 aa27.05■■□□□ 1.92
PPP4C-211ENST00000567642 MPNDQ8N594 471 aa27.04■■□□□ 1.92
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