RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLX4Q8IY92 1834 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 NFKBIEO00221 500 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 APLP1P51693 650 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 RASSF7Q02833 373 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 WDR63Q8IWG1 891 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.08■■□□□ 1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 CACNA1SQ13698 1873 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 NLRP10Q86W26 655 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC93Q567U6 631 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 GOLGA2Q08379 1002 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 NLRP3Q96P20 1036 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 TSPYL6Q8N831 410 aa22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRELPP51888 382 aa22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 STK31Q9BXU1 1019 aa22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 GLTPD2A6NH11 291 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 WDR90Q96KV7 1748 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 DPY19L2Q6NUT2 758 aa21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 PSMD1Q99460 953 aa21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 LAMB2P55268 1798 aa21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 SNED1Q8TER0 1413 aa21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCER2I3L3R5 266 aa21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 BBOX1O75936 387 aa21.94■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 FSTL1Q12841 308 aa21.94■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 KSR2Q6VAB6 950 aa21.94■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 SYNE4Q8N205 404 aa21.94■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 CACNA1FO60840 1977 aa21.94■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABCC4O15439 1325 aa21.93■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 OLFM4Q6UX06 510 aa21.93■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM89AQ96GI7 184 aa21.93■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF521Q96K83 1311 aa21.93■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYD88Q99836 296 aa21.93■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 VAMP4O75379 141 aa21.92■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC4A2P04920 1241 aa21.92■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMC4Q7Z404 712 aa21.92■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 RRAGCQ9HB90 399 aa21.92■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.92■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.92■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 PI4KAP2A4QPH2 592 aa21.91■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.91■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa21.91■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 GRAPQ13588 217 aa21.9■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
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