RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ERFEQ4G0M1 354 aa28.41■■■□□ 2.14
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FLIIQ13045 1269 aa28.4■■■□□ 2.14
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KSR2Q6VAB6 950 aa28.4■■■□□ 2.14
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 G2E3Q7L622 706 aa28.4■■■□□ 2.14
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CHD4Q14839 1912 aa28.39■■■□□ 2.14
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SRGNP10124 158 aa28.39■■■□□ 2.14
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 STYK1Q6J9G0 422 aa28.39■■■□□ 2.14
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TTLL6Q8N841 843 aa28.39■■■□□ 2.14
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADCY9O60503 1353 aa28.38■■■□□ 2.13
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP28.38■■■□□ 2.13
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa28.38■■■□□ 2.13
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PI4KAP2A4QPH2 592 aa28.37■■■□□ 2.13
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa28.37■■■□□ 2.13
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa28.37■■■□□ 2.13
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF428Q96B54 188 aa28.37■■■□□ 2.13
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MASTLQ96GX5 879 aa28.37■■■□□ 2.13
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYD88Q99836 296 aa28.36■■■□□ 2.13
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SH3TC1Q8TE82 1336 aa28.36■■■□□ 2.13
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NPR1P16066 1061 aa28.35■■■□□ 2.13
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC10A5Q5PT55 438 aa28.35■■■□□ 2.13
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CNKSR1Q969H4 720 aa28.35■■■□□ 2.13
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CRY2Q49AN0 593 aa28.34■■■□□ 2.13
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC191Q8NCU4 936 aa28.34■■■□□ 2.13
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NEXNQ0ZGT2 675 aa28.33■■■□□ 2.13
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZBED9Q6R2W3 1325 aa28.33■■■□□ 2.13
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CACNA1SQ13698 1873 aa28.32■■■□□ 2.12
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NLRP3Q96P20 1036 aa28.31■■■□□ 2.12
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LAMB2P55268 1798 aa28.31■■■□□ 2.12
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DNAAF4Q8WXU2 420 aa28.3■■■□□ 2.12
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ALDH1L2Q3SY69 923 aa28.29■■■□□ 2.12
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLX4Q8IY92 1834 aa28.28■■■□□ 2.12
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IGKV5-2P06315 115 aa28.28■■■□□ 2.12
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 YY1P25490 414 aa28.28■■■□□ 2.12
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa28.28■■■□□ 2.12
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SYNE4Q8N205 404 aa28.28■■■□□ 2.12
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM89AQ96GI7 184 aa28.28■■■□□ 2.12
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ALDH1B1P30837 517 aa28.27■■■□□ 2.12
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SSH1Q8WYL5 1049 aa28.27■■■□□ 2.12
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C3orf67Q6ZVT6 689 aa28.26■■■□□ 2.11
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NEURL1BA8MQ27 555 aa28.25■■■□□ 2.11
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SOGA3Q5TF21 947 aa28.24■■■□□ 2.11
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LINS1Q8NG48 757 aa28.24■■■□□ 2.11
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CRAMP1Q96RY5 1269 aa28.24■■■□□ 2.11
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PTPRCP08575 1304 aa28.23■■■□□ 2.11
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C21orf2O43822 256 aa28.23■■■□□ 2.11
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SMC4Q9NTJ3 1288 aa28.23■■■□□ 2.11
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 F6X3S4 739 aa28.22■■■□□ 2.11
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.22■■■□□ 2.11
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CDHR2Q9BYE9 1310 aa28.21■■■□□ 2.11
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa28.2■■■□□ 2.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GCKRQ14397 625 aa28.19■■■□□ 2.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C7orf43Q8WVR3 580 aa28.19■■■□□ 2.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC93Q567U6 631 aa28.18■■■□□ 2.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BEND3Q5T5X7 828 aa28.18■■■□□ 2.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ABCC4O15439 1325 aa28.18■■■□□ 2.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PDE8AO60658 829 aa28.17■■■□□ 2.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UTRNP46939 3433 aa28.17■■■□□ 2.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LTBP3Q9NS15 1303 aa28.17■■■□□ 2.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NFKBIEO00221 500 aa28.16■■■□□ 2.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RARSP54136 660 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RASSF7Q02833 373 aa28.16■■■□□ 2.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SBF1O95248 1867 aa28.15■■■□□ 2.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 H7C1W4 665 aa28.15■■■□□ 2.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa28.15■■■□□ 2.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa28.15■■■□□ 2.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ALDH1L1O75891 902 aa28.14■■■□□ 2.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GRAPQ13588 217 aa28.14■■■□□ 2.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC4A10Q6U841 1118 aa28.14■■■□□ 2.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYH3P11055 1940 aa28.14■■■□□ 2.09
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa28.13■■■□□ 2.09
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TAOK3Q9H2K8 898 aa28.13■■■□□ 2.09
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIF16BQ96L93 1317 aa28.13■■■□□ 2.09
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