RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561868.1

SPNS1-205, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 441 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-205ENST00000561868 PSMD1Q99460 953 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 CNTNAP1P78357 1384 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 CCER2I3L3R5 266 aa20.4■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 POTEIP0CG38 1075 aa20.4■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 POTEJP0CG39 1038 aa20.4■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 CRY2Q49AN0 593 aa20.4■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.4■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 JDP2Q8WYK2 163 aa20.4■□□□□ 0.86
SPNS1-205ENST00000561868 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
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SPNS1-205ENST00000561868 WWC1Q8IX03 1113 aa20.38■□□□□ 0.85
SPNS1-205ENST00000561868 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.38■□□□□ 0.85
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SPNS1-205ENST00000561868 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa20.38■□□□□ 0.85
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SPNS1-205ENST00000561868 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.37■□□□□ 0.85
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SPNS1-205ENST00000561868 MBIPQ9NS73 344 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-205ENST00000561868 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-205ENST00000561868 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
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SPNS1-205ENST00000561868 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-205ENST00000561868 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-205ENST00000561868 SNED1Q8TER0 1413 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-205ENST00000561868 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-205ENST00000561868 ABCC12Q96J65 1359 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-205ENST00000561868 IL16Q14005 1332 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS1-205ENST00000561868 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.33■□□□□ 0.85
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SPNS1-205ENST00000561868 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SPNS1-205ENST00000561868 PDIA6Q15084 440 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS1-205ENST00000561868 OLFM4Q6UX06 510 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS1-205ENST00000561868 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS1-205ENST00000561868 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SPNS1-205ENST00000561868 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.33■□□□□ 0.85
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SPNS1-205ENST00000561868 KRT24Q2M2I5 525 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 PARP10Q53GL7 1025 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.32■□□□□ 0.84
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SPNS1-205ENST00000561868 WDR63Q8IWG1 891 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 VPS33BQ9H267 617 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 RASSF10A6NK89 507 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 FOXN1O15353 648 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 MYL6BP14649 208 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 VEGFBP49765 207 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 GPTP24298 496 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 DEFB115Q30KQ5 88 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 NLRP3Q96P20 1036 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 NTSR2O95665 410 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 SUSD4Q5VX71 490 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 GJA3Q9Y6H8 435 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 TRPM7Q96QT4 1865 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 NIM1KQ8IY84 436 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 MIER1Q8N108 512 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 WBP1LQ9NX94 342 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-205ENST00000561868 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 ZNF521Q96K83 1311 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 PROSER3Q2NL68 480 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 ECE1P42892 770 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-205ENST00000561868 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
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