RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558376.5

RABGGTA-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 1,883 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-204ENST00000558376 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 CRY2Q49AN0 593 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 SLC51AQ86UW1 340 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-204ENST00000558376 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
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RABGGTA-204ENST00000558376 JDP2Q8WYK2 163 aa14.69□□□□□ -0.06
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RABGGTA-204ENST00000558376 EPS15P42566 896 aa14.68□□□□□ -0.06
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RABGGTA-204ENST00000558376 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
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RABGGTA-204ENST00000558376 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-204ENST00000558376 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-204ENST00000558376 MYL6BP14649 208 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-204ENST00000558376 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-204ENST00000558376 ZBTB3Q9H5J0 574 aa14.67□□□□□ -0.06
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RABGGTA-204ENST00000558376 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-204ENST00000558376 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-204ENST00000558376 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.66□□□□□ -0.06
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RABGGTA-204ENST00000558376 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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RABGGTA-204ENST00000558376 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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RABGGTA-204ENST00000558376 NFE2L2Q16236 605 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-204ENST00000558376 GRIPAP1Q4V328 841 aa14.63□□□□□ -0.07
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RABGGTA-204ENST00000558376 ABHD8Q96I13 439 aa14.63□□□□□ -0.07
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RABGGTA-204ENST00000558376 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
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RABGGTA-204ENST00000558376 PDIA6Q15084 440 aa14.61□□□□□ -0.07
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RABGGTA-204ENST00000558376 THSD7BQ9C0I4 1608 aa14.61□□□□□ -0.07
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RABGGTA-204ENST00000558376 GRM1Q13255 1194 aa14.6□□□□□ -0.07
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RABGGTA-204ENST00000558376 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.6□□□□□ -0.07
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RABGGTA-204ENST00000558376 TAF1P21675 1872 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-204ENST00000558376 ANXA1P04083 346 aa14.59□□□□□ -0.07
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RABGGTA-204ENST00000558376 ERBB4Q15303 1308 aa14.59□□□□□ -0.07
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RABGGTA-204ENST00000558376 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
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RABGGTA-204ENST00000558376 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-204ENST00000558376 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-204ENST00000558376 ABCC4O15439 1325 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-204ENST00000558376 AOC2O75106 756 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-204ENST00000558376 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-204ENST00000558376 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-204ENST00000558376 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
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