RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa28.28■■■□□ 2.12
CIPC-208ENST00000557115 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa28.28■■■□□ 2.12
CIPC-208ENST00000557115 CFAP44Q96MT7 982 aa28.28■■■□□ 2.12
CIPC-208ENST00000557115 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa28.28■■■□□ 2.12
CIPC-208ENST00000557115 DDNO94850 711 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
CIPC-208ENST00000557115 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
CIPC-208ENST00000557115 NLRP3Q96P20 1036 aa28.26■■■□□ 2.11
CIPC-208ENST00000557115 CHPF2Q9P2E5 772 aa28.26■■■□□ 2.11
CIPC-208ENST00000557115 SYNE4Q8N205 404 aa28.25■■■□□ 2.11
CIPC-208ENST00000557115 HOXB7P09629 217 aa28.24■■■□□ 2.11
CIPC-208ENST00000557115 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
CIPC-208ENST00000557115 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
CIPC-208ENST00000557115 RIC1Q4ADV7 1423 aa28.24■■■□□ 2.11
CIPC-208ENST00000557115 POTECB2RU33 542 aa28.23■■■□□ 2.11
CIPC-208ENST00000557115 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.23■■■□□ 2.11
CIPC-208ENST00000557115 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa28.23■■■□□ 2.11
CIPC-208ENST00000557115 CRAMP1Q96RY5 1269 aa28.23■■■□□ 2.11
CIPC-208ENST00000557115 MBIPQ9NS73 344 aa28.23■■■□□ 2.11
CIPC-208ENST00000557115 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
CIPC-208ENST00000557115 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
CIPC-208ENST00000557115 IARSP41252 1262 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
CIPC-208ENST00000557115 HTRA3P83110 453 aa28.22■■■□□ 2.11
CIPC-208ENST00000557115 TCIRG1Q13488 830 aa28.22■■■□□ 2.11
CIPC-208ENST00000557115 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
CIPC-208ENST00000557115 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
CIPC-208ENST00000557115 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
CIPC-208ENST00000557115 C3orf67Q6ZVT6 689 aa28.2■■■□□ 2.1
CIPC-208ENST00000557115 NLRP10Q86W26 655 aa28.2■■■□□ 2.1
CIPC-208ENST00000557115 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa28.2■■■□□ 2.1
CIPC-208ENST00000557115 PSMD1Q99460 953 aa28.2■■■□□ 2.1
CIPC-208ENST00000557115 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
CIPC-208ENST00000557115 RNF123Q5XPI4 1314 aa28.19■■■□□ 2.1
CIPC-208ENST00000557115 WDR90Q96KV7 1748 aa28.19■■■□□ 2.1
CIPC-208ENST00000557115 IQCA1LA6NCM1 817 aa28.19■■■□□ 2.1
CIPC-208ENST00000557115 GNAI1P63096 354 aa28.19■■■□□ 2.1
CIPC-208ENST00000557115 GRIPAP1Q4V328 841 aa28.19■■■□□ 2.1
CIPC-208ENST00000557115 SLC10A5Q5PT55 438 aa28.19■■■□□ 2.1
CIPC-208ENST00000557115 JDP2Q8WYK2 163 aa28.19■■■□□ 2.1
CIPC-208ENST00000557115 IFT57Q9NWB7 429 aa28.19■■■□□ 2.1
CIPC-208ENST00000557115 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa28.18■■■□□ 2.1
CIPC-208ENST00000557115 PLBD2Q8NHP8 589 aa28.18■■■□□ 2.1
CIPC-208ENST00000557115 HYPKQ9NX55 129 aa28.18■■■□□ 2.1
CIPC-208ENST00000557115 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
CIPC-208ENST00000557115 ZNF853P0CG23 659 aa28.16■■■□□ 2.1
CIPC-208ENST00000557115 ZNF428Q96B54 188 aa28.16■■■□□ 2.1
CIPC-208ENST00000557115 SH3TC1Q8TE82 1336 aa28.16■■■□□ 2.1
CIPC-208ENST00000557115 ZNF541Q9H0D2 1346 aa28.16■■■□□ 2.1
CIPC-208ENST00000557115 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
CIPC-208ENST00000557115 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
CIPC-208ENST00000557115 FZD9O00144 591 aa28.13■■■□□ 2.09
CIPC-208ENST00000557115 CHADLQ6NUI6 762 aa28.13■■■□□ 2.09
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CIPC-208ENST00000557115 KLRG1Q96E93 195 aa28.13■■■□□ 2.09
CIPC-208ENST00000557115 CCDC184Q52MB2 194 aa28.12■■■□□ 2.09
CIPC-208ENST00000557115 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
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CIPC-208ENST00000557115 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa28.11■■■□□ 2.09
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CIPC-208ENST00000557115 GOLGA2Q08379 1002 aa28.1■■■□□ 2.09
CIPC-208ENST00000557115 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.1■■■□□ 2.09
CIPC-208ENST00000557115 HACL1Q9UJ83 578 aa28.1■■■□□ 2.09
CIPC-208ENST00000557115 BBOX1O75936 387 aa28.09■■■□□ 2.09
CIPC-208ENST00000557115 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
CIPC-208ENST00000557115 SLC51AQ86UW1 340 aa28.09■■■□□ 2.09
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CIPC-208ENST00000557115 GJA3Q9Y6H8 435 aa28.09■■■□□ 2.09
CIPC-208ENST00000557115 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
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CIPC-208ENST00000557115 ISCA1Q9BUE6 129 aa28.08■■■□□ 2.09
CIPC-208ENST00000557115 CHMP4AQ9BY43 222 aa28.08■■■□□ 2.09
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CIPC-208ENST00000557115 C8orf58Q8NAV2 365 aa28.07■■■□□ 2.08
CIPC-208ENST00000557115 FAM89AQ96GI7 184 aa28.07■■■□□ 2.08
CIPC-208ENST00000557115 CLEC11AQ9Y240 323 aa28.07■■■□□ 2.08
CIPC-208ENST00000557115 EPHX2P34913 555 aa28.06■■■□□ 2.08
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CIPC-208ENST00000557115 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
CIPC-208ENST00000557115 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
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CIPC-208ENST00000557115 MPNDQ8N594 471 aa28.04■■■□□ 2.08
CIPC-208ENST00000557115 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
CIPC-208ENST00000557115 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
CIPC-208ENST00000557115 VPS33BQ9H267 617 aa28.03■■■□□ 2.08
CIPC-208ENST00000557115 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
CIPC-208ENST00000557115 DDX58O95786 925 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
CIPC-208ENST00000557115 TMC4Q7Z404 712 aa28.01■■■□□ 2.07
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