RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 NBPF26B4DH59 902 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 DLK2Q6UY11 383 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 LARGE2Q8N3Y3 721 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 NBPF15Q8N660 670 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 GNAT3A8MTJ3 354 aa18.54■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 CRY2Q49AN0 593 aa18.54■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 NUTM1Q86Y26 1132 aa18.54■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 ZNF408Q9H9D4 720 aa18.54■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 GPRC5DQ9NZD1 345 aa18.54■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 ZNF652Q9Y2D9 606 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 BTBD11A6QL63 1104 aa18.52■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 HHIPL1Q96JK4 782 aa18.52■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
CS-230ENST00000551968 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
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CS-230ENST00000551968 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CS-230ENST00000551968 SHTN1A0MZ66 631 aa18.5■□□□□ 0.55
CS-230ENST00000551968 PGAP2Q9UHJ9 254 aa18.5■□□□□ 0.55
CS-230ENST00000551968 KNSTRNQ9Y448 316 aa18.5■□□□□ 0.55
CS-230ENST00000551968 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
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CS-230ENST00000551968 CXCL9Q07325 125 aa18.49■□□□□ 0.55
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CS-230ENST00000551968 C3orf67Q6ZVT6 689 aa18.49■□□□□ 0.55
CS-230ENST00000551968 NIM1KQ8IY84 436 aa18.49■□□□□ 0.55
CS-230ENST00000551968 TRPM4Q8TD43 1214 aa18.49■□□□□ 0.55
CS-230ENST00000551968 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa18.49■□□□□ 0.55
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CS-230ENST00000551968 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CS-230ENST00000551968 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CS-230ENST00000551968 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CS-230ENST00000551968 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-230ENST00000551968 RIC1Q4ADV7 1423 aa18.48■□□□□ 0.55
CS-230ENST00000551968 PPIP5K2O43314 1243 aa18.47■□□□□ 0.55
CS-230ENST00000551968 GAS2L2Q8NHY3 880 aa18.47■□□□□ 0.55
CS-230ENST00000551968 PHACTR3Q96KR7 559 aa18.47■□□□□ 0.55
CS-230ENST00000551968 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
CS-230ENST00000551968 NOGQ13253 232 aa18.46■□□□□ 0.55
CS-230ENST00000551968 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 HUNKP57058 714 aa18.45■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 UBN2Q6ZU65 1347 aa18.45■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 RGL2O15211 777 aa18.44■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 USP48Q86UV5 1035 aa18.44■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 RNF186Q9NXI6 227 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 ZNRF3Q9ULT6 936 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 KIF7Q2M1P5 1343 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 TRPA1O75762 1119 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 RAD17O75943 681 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 GPTP24298 496 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 SUSD4Q5VX71 490 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 CDC37L1Q7L3B6 337 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 NGEFQ8N5V2 710 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 CRAMP1Q96RY5 1269 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 AKAP11Q9UKA4 1901 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 LAMB4A4D0S4 1761 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 RGMBQ6NW40 437 aa18.41■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 MCM10Q7L590 875 aa18.41■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 NYXQ9GZU5 481 aa18.41■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 SAGE1Q9NXZ1 904 aa18.41■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.4■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 GRIPAP1Q4V328 841 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 TTLL7Q6ZT98 887 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CS-230ENST00000551968 YDJCA8MPS7 323 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 EGFRP00533 1210 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 DCTN1Q14203 1278 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 BCL2L13Q9BXK5 485 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 HPS5Q9UPZ3 1129 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 ADM5C9JUS6 153 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 NTSR2O95665 410 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 PRKAR2BP31323 418 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 LAMB2P55268 1798 aa18.37■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 SAMD7Q7Z3H4 446 aa18.37■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 CSRNP1Q96S65 589 aa18.37■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 MIS18AQ9NYP9 233 aa18.37■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa18.37■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 CDHR2Q9BYE9 1310 aa18.37■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 DUOX1Q9NRD9 1551 aa18.37■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 TAF1P21675 1872 aa18.37■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 ABCC4O15439 1325 aa18.36■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 MICALL2Q8IY33 904 aa18.36■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 RSPH6AQ9H0K4 717 aa18.36■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 ZBTB3Q9H5J0 574 aa18.36■□□□□ 0.53
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