RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542100.5

E2F6-211, Transcript of E2F transcription factor 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene E2F6, Length 3,450 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6-211ENST00000542100 NCAPD2Q15021 1401 aa18.26■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 LRSAM1Q6UWE0 723 aa18.26■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 SMC3Q9UQE7 1217 aa18.26■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 MEGF6O75095 1541 aa18.26■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 TTC5Q8N0Z6 440 aa18.25■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 MPNDQ8N594 471 aa18.25■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 IFNL2Q8IZJ0 200 aa18.25■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 CCDC171Q6TFL3 1326 aa18.24■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 FIBPO43427 364 aa18.24■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 TMEM94Q12767 1356 aa18.24■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 STX6O43752 255 aa18.24■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 NECTIN1Q15223 517 aa18.24■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 CREB3L3Q68CJ9 461 aa18.24■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 GJB2P29033 226 aa18.24■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 ST3GAL1Q11201 340 aa18.24■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 ME3Q16798 604 aa18.24■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 UTYO14607 1347 aa18.23■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 TFCP2Q12800 502 aa18.23■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa18.23■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 CHMP3Q9Y3E7 222 aa18.23■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 MBD3O95983 291 aa18.22■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 SLFNL1Q499Z3 407 aa18.22■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 LRP10Q7Z4F1 713 aa18.22■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 TPCN1Q9ULQ1 816 aa18.22■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 A0A087WZG4 1122 aa18.22■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 CABP4P57796 275 aa18.22■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa18.21■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 TCHHQ07283 1943 aa18.21■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 FAM173BQ6P4H8 233 aa18.21■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa18.21■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 HDAC5Q9UQL6 1122 aa18.21■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 SLC27A2O14975 620 aa18.21■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 HSPA2P54652 639 aa18.21■□□□□ 0.51
E2F6-211ENST00000542100 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 STK3Q13188 491 aa18.2■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 FERMT3Q86UX7 667 aa18.2■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 MAP4K1Q92918 833 aa18.2■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 DBNDD2Q9BQY9 259 aa18.19■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 VPS53Q5VIR6 699 aa18.19■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 DCAF5Q96JK2 942 aa18.19■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 F13A1P00488 732 aa18.19■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 FMNL2Q96PY5 1086 aa18.19■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa18.18■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 LMBR1LQ6UX01 489 aa18.18■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 TTLL7Q6ZT98 887 aa18.18■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 ZSCAN30Q86W11 494 aa18.18■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 PKNOX2Q96KN3 472 aa18.18■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 MTMR6Q9Y217 621 aa18.18■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 NBPF26B4DH59 902 aa18.17■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 A1BGP04217 495 aa18.17■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 NBPF14Q5TI25 921 aa18.17■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 NBPF15Q8N660 670 aa18.17■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 TSPY26PQ9H489 355 aa18.17■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 TNNI3KQ59H18 835 aa18.17■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa18.17■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 MST1RQ04912 1400 aa18.16■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 ZBTB3Q9H5J0 574 aa18.16■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 NEUROD6Q96NK8 337 aa18.15■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 LRRC2Q9BYS8 371 aa18.15■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 COL15A1P39059 1388 aa18.15■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 MSNP26038 577 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 PDLIM2Q96JY6 352 aa18.15■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 C5P01031 1676 aa18.15■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 TIMM10P62072 90 aa18.15■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 KCNB2Q92953 911 aa18.15■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 COPRSQ9NQ92 184 aa18.15■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa18.14■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 TM6SF1Q9BZW5 370 aa18.14■□□□□ 0.5
E2F6-211ENST00000542100 ADAMTSL3P82987 1691 aa18.14■□□□□ 0.49
E2F6-211ENST00000542100 PPFIA3O75145 1194 aa18.14■□□□□ 0.49
E2F6-211ENST00000542100 TAF5LO75529 589 aa18.14■□□□□ 0.49
E2F6-211ENST00000542100 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
E2F6-211ENST00000542100 GIMAP6Q6P9H5 292 aa18.14■□□□□ 0.49
E2F6-211ENST00000542100 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa18.14■□□□□ 0.49
E2F6-211ENST00000542100 CDC37L1Q7L3B6 337 aa18.14■□□□□ 0.49
E2F6-211ENST00000542100 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
E2F6-211ENST00000542100 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 196.5 ms