RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 ZBTB10Q96DT7 871 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 FHOD1Q9Y613 1164 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 ZMYM3Q14202 1370 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 FHAD1B1AJZ9 1412 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 ERLIN2O94905 339 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 SCRN1Q12765 414 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 MICALCLQ6ZW33 695 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 KIAA0825Q8IV33 1275 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 SPC24Q8NBT2 197 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 FAM81AQ8TBF8 368 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 HDAC7Q8WUI4 952 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 STK31Q9BXU1 1019 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 JADE2Q9NQC1 790 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 PDRG1Q9NUG6 133 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 TBC1D7Q9P0N9 293 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 ODF2LQ9ULJ1 636 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 ATP8B1O43520 1251 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 PLA2G4AP47712 749 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 DDR1Q08345 913 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 KCNA1Q09470 495 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM110Q86TL2 294 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC102AQ96A19 550 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 ERO1AQ96HE7 468 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 SCLT1Q96NL6 688 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 MYO6Q9UM54 1294 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 HARSP12081 509 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 CATIPQ7Z7H3 387 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 PARP9Q8IXQ6 854 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 TSGA10Q9BZW7 698 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 INCENPQ9NQS7 918 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 RGL1Q9NZL6 768 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 KDRP35968 1356 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 ANKRD62A6NC57 917 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 OPA1O60313 960 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 PKN1Q16512 942 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 SAPCD2Q86UD0 394 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 UNCXA6NJT0 531 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 LMAN1P49257 510 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 MPP3Q13368 585 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC65Q8IXS2 484 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 APLP1P51693 650 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 OSCARQ8IYS5 282 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 CLIP1P30622 1438 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 CHUKO15111 745 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 BDNFP23560 247 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 USP4Q13107 963 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 AMOTL1Q8IY63 956 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC114Q96M63 670 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 MMEP08473 750 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 CYB5RLQ6IPT4 315 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC88BA6NC98 1476 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 GOLGA6L10A6NI86 522 aa7.15□□□□□ -1.26
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PDE4D-216ENST00000507116 CA8P35219 290 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 FOSBP53539 338 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa7.15□□□□□ -1.26
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PDE4D-216ENST00000507116 RCSD1Q6JBY9 416 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 COMMD10Q9Y6G5 202 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 FANCD2Q9BXW9 1451 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 ERC2O15083 957 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 ATP6V1G1O75348 118 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 SLC8A3P57103 927 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 KRT72Q14CN4 511 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 POSTNQ15063 836 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 IQCA1Q86XH1 822 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 MFN1Q8IWA4 741 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 UBXN6Q9BZV1 441 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 HMGXB3Q12766 1538 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 KIAA0753Q2KHM9 967 aa7.14□□□□□ -1.27
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