RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.23■■□□□ 1.79
NELFE-212ENST00000492539 HACL1Q9UJ83 578 aa26.23■■□□□ 1.79
NELFE-212ENST00000492539 COL4A5P29400 1685 aa26.22■■□□□ 1.79
NELFE-212ENST00000492539 NTSR2O95665 410 aa26.22■■□□□ 1.79
NELFE-212ENST00000492539 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.21■■□□□ 1.79
NELFE-212ENST00000492539 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
NELFE-212ENST00000492539 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
NELFE-212ENST00000492539 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.21■■□□□ 1.79
NELFE-212ENST00000492539 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
NELFE-212ENST00000492539 GPC2Q8N158 579 aa26.2■■□□□ 1.78
NELFE-212ENST00000492539 CNTNAP1P78357 1384 aa26.2■■□□□ 1.78
NELFE-212ENST00000492539 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.19■■□□□ 1.78
NELFE-212ENST00000492539 EPHX2P34913 555 aa26.19■■□□□ 1.78
NELFE-212ENST00000492539 PDIA6Q15084 440 aa26.19■■□□□ 1.78
NELFE-212ENST00000492539 TNS4Q8IZW8 715 aa26.19■■□□□ 1.78
NELFE-212ENST00000492539 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.19■■□□□ 1.78
NELFE-212ENST00000492539 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.19■■□□□ 1.78
NELFE-212ENST00000492539 RIPK4P57078 832 aa26.18■■□□□ 1.78
NELFE-212ENST00000492539 LTBP1Q14766 1721 aa26.18■■□□□ 1.78
NELFE-212ENST00000492539 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.18■■□□□ 1.78
NELFE-212ENST00000492539 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
NELFE-212ENST00000492539 JDP2Q8WYK2 163 aa26.18■■□□□ 1.78
NELFE-212ENST00000492539 RALBP1Q15311 655 aa26.17■■□□□ 1.78
NELFE-212ENST00000492539 PARP10Q53GL7 1025 aa26.17■■□□□ 1.78
NELFE-212ENST00000492539 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.17■■□□□ 1.78
NELFE-212ENST00000492539 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
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NELFE-212ENST00000492539 C3orf67Q6ZVT6 689 aa26.16■■□□□ 1.78
NELFE-212ENST00000492539 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
NELFE-212ENST00000492539 SLC51AQ86UW1 340 aa26.15■■□□□ 1.78
NELFE-212ENST00000492539 TMEM88BA6NKF7 163 aa26.14■■□□□ 1.78
NELFE-212ENST00000492539 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
NELFE-212ENST00000492539 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
NELFE-212ENST00000492539 PROSER3Q2NL68 480 aa26.14■■□□□ 1.78
NELFE-212ENST00000492539 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.14■■□□□ 1.78
NELFE-212ENST00000492539 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
NELFE-212ENST00000492539 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.13■■□□□ 1.77
NELFE-212ENST00000492539 SLC10A5Q5PT55 438 aa26.13■■□□□ 1.77
NELFE-212ENST00000492539 ANXA1P04083 346 aa26.12■■□□□ 1.77
NELFE-212ENST00000492539 NLRP3Q96P20 1036 aa26.12■■□□□ 1.77
NELFE-212ENST00000492539 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
NELFE-212ENST00000492539 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
NELFE-212ENST00000492539 CNTROBQ8N137 903 aa26.11■■□□□ 1.77
NELFE-212ENST00000492539 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.11■■□□□ 1.77
NELFE-212ENST00000492539 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.1■■□□□ 1.77
NELFE-212ENST00000492539 SCNN1DP51172 638 aa26.09■■□□□ 1.77
NELFE-212ENST00000492539 ABCC4O15439 1325 aa26.09■■□□□ 1.77
NELFE-212ENST00000492539 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
NELFE-212ENST00000492539 VEGFBP49765 207 aa26.08■■□□□ 1.77
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NELFE-212ENST00000492539 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.08■■□□□ 1.77
NELFE-212ENST00000492539 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
NELFE-212ENST00000492539 COPS6Q7L5N1 327 aa26.07■■□□□ 1.76
NELFE-212ENST00000492539 VPS33BQ9H267 617 aa26.07■■□□□ 1.76
NELFE-212ENST00000492539 RASSF10A6NK89 507 aa26.06■■□□□ 1.76
NELFE-212ENST00000492539 FOXN1O15353 648 aa26.06■■□□□ 1.76
NELFE-212ENST00000492539 CAPN15O75808 1086 aa26.06■■□□□ 1.76
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NELFE-212ENST00000492539 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.06■■□□□ 1.76
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NELFE-212ENST00000492539 CHL1O00533 1208 aa26.05■■□□□ 1.76
NELFE-212ENST00000492539 PPIP5K2O43314 1243 aa26.05■■□□□ 1.76
NELFE-212ENST00000492539 EPS15P42566 896 aa26.05■■□□□ 1.76
NELFE-212ENST00000492539 NECTIN2Q92692 538 aa26.05■■□□□ 1.76
NELFE-212ENST00000492539 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
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NELFE-212ENST00000492539 TCIRG1Q13488 830 aa26.04■■□□□ 1.76
NELFE-212ENST00000492539 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.04■■□□□ 1.76
NELFE-212ENST00000492539 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
NELFE-212ENST00000492539 TAF1P21675 1872 aa26.04■■□□□ 1.76
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NELFE-212ENST00000492539 AOC3Q16853 763 aa26.03■■□□□ 1.76
NELFE-212ENST00000492539 KRT24Q2M2I5 525 aa26.03■■□□□ 1.76
NELFE-212ENST00000492539 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.03■■□□□ 1.76
NELFE-212ENST00000492539 BBOX1O75936 387 aa26.02■■□□□ 1.76
NELFE-212ENST00000492539 DEFB115Q30KQ5 88 aa26.02■■□□□ 1.76
NELFE-212ENST00000492539 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
NELFE-212ENST00000492539 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.02■■□□□ 1.76
NELFE-212ENST00000492539 LRRC37AA6NMS7 1700 aa26.02■■□□□ 1.76
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NELFE-212ENST00000492539 NEUROD2Q15784 382 aa26.01■■□□□ 1.75
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NELFE-212ENST00000492539 RUNDC1Q96C34 613 aa26.01■■□□□ 1.75
NELFE-212ENST00000492539 THSD7BQ9C0I4 1608 aa26■■□□□ 1.75
NELFE-212ENST00000492539 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26■■□□□ 1.75
NELFE-212ENST00000492539 PRDM10Q9NQV6 1147 aa26■■□□□ 1.75
NELFE-212ENST00000492539 WBP1LQ9NX94 342 aa26■■□□□ 1.75
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NELFE-212ENST00000492539 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.99■■□□□ 1.75
NELFE-212ENST00000492539 ZNRF3Q9ULT6 936 aa25.99■■□□□ 1.75
NELFE-212ENST00000492539 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.99■■□□□ 1.75
NELFE-212ENST00000492539 HOXB7P09629 217 aa25.98■■□□□ 1.75
NELFE-212ENST00000492539 CXCL9Q07325 125 aa25.98■■□□□ 1.75
NELFE-212ENST00000492539 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
NELFE-212ENST00000492539 GRAPQ13588 217 aa25.98■■□□□ 1.75
NELFE-212ENST00000492539 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
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