RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, human

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HOXB3-210	ENST00000489475	CAMTA2	O94983	1202 aa		33.18	■■■□□ 2.9
HOXB3-210	ENST00000489475	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
HOXB3-210	ENST00000489475	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
HOXB3-210	ENST00000489475	RPS6KA4	O75676	772 aa		33.16	■■■□□ 2.9
HOXB3-210	ENST00000489475	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
HOXB3-210	ENST00000489475	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
HOXB3-210	ENST00000489475	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		33.15	■■■□□ 2.9
HOXB3-210	ENST00000489475	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
HOXB3-210	ENST00000489475	FOXO4	P98177	505 aa		33.14	■■■□□ 2.9
HOXB3-210	ENST00000489475	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		33.14	■■■□□ 2.9
HOXB3-210	ENST00000489475	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		33.14	■■■□□ 2.9
HOXB3-210	ENST00000489475	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		33.14	■■■□□ 2.9
HOXB3-210	ENST00000489475	GNPAT	O15228	680 aa		33.14	■■■□□ 2.9
HOXB3-210	ENST00000489475	C8orf34	Q49A92	452 aa		33.14	■■■□□ 2.9
HOXB3-210	ENST00000489475	EP400	Q96L91	3159 aa		33.14	■■■□□ 2.9
HOXB3-210	ENST00000489475	POTEA	Q6S8J7	498 aa		33.13	■■■□□ 2.89
HOXB3-210	ENST00000489475	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		33.13	■■■□□ 2.89
HOXB3-210	ENST00000489475	FAM89A	Q96GI7	184 aa		33.13	■■■□□ 2.89
HOXB3-210	ENST00000489475	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
HOXB3-210	ENST00000489475	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		33.13	■■■□□ 2.89
HOXB3-210	ENST00000489475	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		33.12	■■■□□ 2.89
HOXB3-210	ENST00000489475	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		33.12	■■■□□ 2.89
HOXB3-210	ENST00000489475	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		33.12	■■■□□ 2.89
HOXB3-210	ENST00000489475	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
HOXB3-210	ENST00000489475	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		33.1	■■■□□ 2.89
HOXB3-210	ENST00000489475	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
HOXB3-210	ENST00000489475	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		33.1	■■■□□ 2.89
HOXB3-210	ENST00000489475	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	33.09	■■■□□ 2.89
HOXB3-210	ENST00000489475	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
HOXB3-210	ENST00000489475	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		33.09	■■■□□ 2.89
HOXB3-210	ENST00000489475	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		33.09	■■■□□ 2.89
HOXB3-210	ENST00000489475	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		33.09	■■■□□ 2.89
HOXB3-210	ENST00000489475	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		33.09	■■■□□ 2.89
HOXB3-210	ENST00000489475	RGL2	O15211	777 aa		33.08	■■■□□ 2.89
HOXB3-210	ENST00000489475	PARP10	Q53GL7	1025 aa		33.08	■■■□□ 2.89
HOXB3-210	ENST00000489475	AK7	Q96M32	723 aa		33.08	■■■□□ 2.89
HOXB3-210	ENST00000489475	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		33.08	■■■□□ 2.89
HOXB3-210	ENST00000489475	C4B	P0C0L5	1744 aa		33.08	■■■□□ 2.89
HOXB3-210	ENST00000489475	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		33.07	■■■□□ 2.89
HOXB3-210	ENST00000489475	COPRS	Q9NQ92	184 aa		33.07	■■■□□ 2.89
HOXB3-210	ENST00000489475	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		33.06	■■■□□ 2.88
HOXB3-210	ENST00000489475	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
HOXB3-210	ENST00000489475	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	33.06	■■■□□ 2.88
HOXB3-210	ENST00000489475	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
HOXB3-210	ENST00000489475	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		33.05	■■■□□ 2.88
HOXB3-210	ENST00000489475	SIL1	Q9H173	461 aa		33.05	■■■□□ 2.88
HOXB3-210	ENST00000489475	NARF	Q9UHQ1	456 aa		33.05	■■■□□ 2.88
HOXB3-210	ENST00000489475	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
HOXB3-210	ENST00000489475	ZPR1	O75312	459 aa		33.03	■■■□□ 2.88
HOXB3-210	ENST00000489475	SUSD4	Q5VX71	490 aa		33.03	■■■□□ 2.88
HOXB3-210	ENST00000489475	SMIM5	Q71RC9	77 aa		33.03	■■■□□ 2.88
HOXB3-210	ENST00000489475	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
HOXB3-210	ENST00000489475	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
HOXB3-210	ENST00000489475	PDE1A	P54750	535 aa		33.02	■■■□□ 2.88
HOXB3-210	ENST00000489475	SYNE4	Q8N205	404 aa		33.02	■■■□□ 2.88
HOXB3-210	ENST00000489475	TTC22	Q5TAA0	569 aa		33.02	■■■□□ 2.88
HOXB3-210	ENST00000489475	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
HOXB3-210	ENST00000489475	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		33.02	■■■□□ 2.88
HOXB3-210	ENST00000489475	MX1	P20591	662 aa		33.01	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		33.01	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	TXNRD1	Q16881	649 aa		33	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		33	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	SCN7A	Q01118	1682 aa		33	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	APBA3	O96018	575 aa		33	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		33	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		33	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	PLSCR1	O15162	318 aa		32.99	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	CSF1R	P07333	972 aa		32.99	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	FAM177B	A6PVY3	158 aa		32.98	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	PDE8A	O60658	829 aa		32.98	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	SASH1	O94885	1247 aa		32.98	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		32.98	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		32.98	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	PHF14	O94880	888 aa		32.98	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	ADRA2B	P18089	450 aa		32.98	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	RFC4	P35249	363 aa		32.98	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	STAP2	Q9UGK3	403 aa		32.98	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	CTSW	P56202	376 aa		32.97	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		32.97	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		32.96	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	PROM2	Q8N271	834 aa		32.95	■■■□□ 2.87
HOXB3-210	ENST00000489475	NTSR2	O95665	410 aa		32.95	■■■□□ 2.86
HOXB3-210	ENST00000489475	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		32.95	■■■□□ 2.86
HOXB3-210	ENST00000489475	AOX1	Q06278	1338 aa		32.94	■■■□□ 2.86
HOXB3-210	ENST00000489475	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
HOXB3-210	ENST00000489475	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
HOXB3-210	ENST00000489475	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
HOXB3-210	ENST00000489475	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		32.93	■■■□□ 2.86
HOXB3-210	ENST00000489475	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
HOXB3-210	ENST00000489475	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
HOXB3-210	ENST00000489475	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		32.92	■■■□□ 2.86
HOXB3-210	ENST00000489475	MYH3	P11055	1940 aa		32.91	■■■□□ 2.86
HOXB3-210	ENST00000489475	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		32.91	■■■□□ 2.86
HOXB3-210	ENST00000489475	AACS	Q86V21	672 aa		32.91	■■■□□ 2.86
HOXB3-210	ENST00000489475	SETDB2	Q96T68	719 aa		32.91	■■■□□ 2.86
HOXB3-210	ENST00000489475	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86

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